Protein–RNA interactions for Protein: Q15042

RAB3GAP1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, humanhuman

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Length 981 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP1Q15042 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB3GAP1Q15042 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB3GAP1Q15042 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB3GAP1Q15042 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB3GAP1Q15042 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB3GAP1Q15042 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB3GAP1Q15042 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB3GAP1Q15042 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB3GAP1Q15042 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
RAB3GAP1Q15042 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
RAB3GAP1Q15042 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
RAB3GAP1Q15042 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
RAB3GAP1Q15042 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB3GAP1Q15042 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB3GAP1Q15042 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB3GAP1Q15042 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB3GAP1Q15042 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB3GAP1Q15042 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB3GAP1Q15042 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB3GAP1Q15042 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB3GAP1Q15042 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB3GAP1Q15042 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB3GAP1Q15042 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB3GAP1Q15042 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB3GAP1Q15042 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB3GAP1Q15042 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB3GAP1Q15042 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB3GAP1Q15042 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB3GAP1Q15042 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB3GAP1Q15042 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB3GAP1Q15042 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB3GAP1Q15042 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB3GAP1Q15042 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB3GAP1Q15042 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB3GAP1Q15042 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB3GAP1Q15042 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB3GAP1Q15042 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB3GAP1Q15042 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB3GAP1Q15042 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB3GAP1Q15042 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB3GAP1Q15042 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB3GAP1Q15042 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB3GAP1Q15042 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB3GAP1Q15042 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB3GAP1Q15042 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB3GAP1Q15042 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB3GAP1Q15042 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB3GAP1Q15042 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB3GAP1Q15042 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB3GAP1Q15042 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB3GAP1Q15042 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB3GAP1Q15042 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB3GAP1Q15042 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB3GAP1Q15042 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB3GAP1Q15042 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB3GAP1Q15042 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB3GAP1Q15042 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB3GAP1Q15042 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB3GAP1Q15042 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB3GAP1Q15042 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB3GAP1Q15042 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB3GAP1Q15042 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB3GAP1Q15042 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB3GAP1Q15042 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB3GAP1Q15042 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB3GAP1Q15042 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB3GAP1Q15042 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB3GAP1Q15042 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB3GAP1Q15042 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB3GAP1Q15042 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB3GAP1Q15042 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB3GAP1Q15042 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB3GAP1Q15042 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB3GAP1Q15042 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB3GAP1Q15042 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB3GAP1Q15042 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB3GAP1Q15042 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB3GAP1Q15042 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB3GAP1Q15042 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB3GAP1Q15042 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB3GAP1Q15042 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB3GAP1Q15042 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB3GAP1Q15042 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB3GAP1Q15042 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB3GAP1Q15042 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB3GAP1Q15042 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB3GAP1Q15042 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB3GAP1Q15042 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB3GAP1Q15042 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB3GAP1Q15042 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB3GAP1Q15042 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB3GAP1Q15042 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB3GAP1Q15042 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB3GAP1Q15042 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB3GAP1Q15042 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB3GAP1Q15042 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB3GAP1Q15042 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB3GAP1Q15042 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB3GAP1Q15042 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB3GAP1Q15042 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
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