Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

Predictions only

Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SHPRHQ149N8 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SHPRHQ149N8 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SHPRHQ149N8 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SHPRHQ149N8 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SHPRHQ149N8 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SHPRHQ149N8 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SHPRHQ149N8 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SHPRHQ149N8 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SHPRHQ149N8 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SHPRHQ149N8 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SHPRHQ149N8 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SHPRHQ149N8 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SHPRHQ149N8 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SHPRHQ149N8 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SHPRHQ149N8 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SHPRHQ149N8 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SHPRHQ149N8 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SHPRHQ149N8 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SHPRHQ149N8 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SHPRHQ149N8 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SHPRHQ149N8 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SHPRHQ149N8 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SHPRHQ149N8 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SHPRHQ149N8 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SHPRHQ149N8 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SHPRHQ149N8 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SHPRHQ149N8 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SHPRHQ149N8 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SHPRHQ149N8 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SHPRHQ149N8 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SHPRHQ149N8 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SHPRHQ149N8 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SHPRHQ149N8 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SHPRHQ149N8 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SHPRHQ149N8 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SHPRHQ149N8 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SHPRHQ149N8 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SHPRHQ149N8 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SHPRHQ149N8 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SHPRHQ149N8 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SHPRHQ149N8 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SHPRHQ149N8 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SHPRHQ149N8 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SHPRHQ149N8 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SHPRHQ149N8 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SHPRHQ149N8 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SHPRHQ149N8 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SHPRHQ149N8 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SHPRHQ149N8 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SHPRHQ149N8 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SHPRHQ149N8 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SHPRHQ149N8 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SHPRHQ149N8 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SHPRHQ149N8 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SHPRHQ149N8 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SHPRHQ149N8 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SHPRHQ149N8 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SHPRHQ149N8 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SHPRHQ149N8 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SHPRHQ149N8 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SHPRHQ149N8 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SHPRHQ149N8 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SHPRHQ149N8 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SHPRHQ149N8 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SHPRHQ149N8 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SHPRHQ149N8 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SHPRHQ149N8 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SHPRHQ149N8 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SHPRHQ149N8 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SHPRHQ149N8 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SHPRHQ149N8 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SHPRHQ149N8 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SHPRHQ149N8 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SHPRHQ149N8 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SHPRHQ149N8 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SHPRHQ149N8 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SHPRHQ149N8 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SHPRHQ149N8 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SHPRHQ149N8 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SHPRHQ149N8 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SHPRHQ149N8 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SHPRHQ149N8 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SHPRHQ149N8 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SHPRHQ149N8 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SHPRHQ149N8 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SHPRHQ149N8 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SHPRHQ149N8 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SHPRHQ149N8 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SHPRHQ149N8 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SHPRHQ149N8 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SHPRHQ149N8 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SHPRHQ149N8 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SHPRHQ149N8 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SHPRHQ149N8 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SHPRHQ149N8 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SHPRHQ149N8 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SHPRHQ149N8 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SHPRHQ149N8 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SHPRHQ149N8 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
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