Protein–RNA interactions for Protein: Q14995

NR1D2, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 2, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1D2Q14995 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NR1D2Q14995 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NR1D2Q14995 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NR1D2Q14995 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NR1D2Q14995 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NR1D2Q14995 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NR1D2Q14995 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NR1D2Q14995 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NR1D2Q14995 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NR1D2Q14995 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NR1D2Q14995 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NR1D2Q14995 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NR1D2Q14995 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NR1D2Q14995 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NR1D2Q14995 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NR1D2Q14995 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NR1D2Q14995 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NR1D2Q14995 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NR1D2Q14995 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NR1D2Q14995 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NR1D2Q14995 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NR1D2Q14995 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NR1D2Q14995 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NR1D2Q14995 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NR1D2Q14995 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NR1D2Q14995 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NR1D2Q14995 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NR1D2Q14995 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NR1D2Q14995 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NR1D2Q14995 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NR1D2Q14995 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NR1D2Q14995 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NR1D2Q14995 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NR1D2Q14995 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NR1D2Q14995 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NR1D2Q14995 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NR1D2Q14995 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NR1D2Q14995 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NR1D2Q14995 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
NR1D2Q14995 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NR1D2Q14995 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NR1D2Q14995 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NR1D2Q14995 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NR1D2Q14995 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NR1D2Q14995 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NR1D2Q14995 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NR1D2Q14995 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NR1D2Q14995 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
NR1D2Q14995 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NR1D2Q14995 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NR1D2Q14995 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NR1D2Q14995 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NR1D2Q14995 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NR1D2Q14995 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NR1D2Q14995 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NR1D2Q14995 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NR1D2Q14995 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NR1D2Q14995 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NR1D2Q14995 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NR1D2Q14995 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NR1D2Q14995 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NR1D2Q14995 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
NR1D2Q14995 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NR1D2Q14995 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NR1D2Q14995 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NR1D2Q14995 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
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NR1D2Q14995 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
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NR1D2Q14995 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NR1D2Q14995 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NR1D2Q14995 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NR1D2Q14995 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NR1D2Q14995 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NR1D2Q14995 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NR1D2Q14995 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NR1D2Q14995 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NR1D2Q14995 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NR1D2Q14995 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NR1D2Q14995 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NR1D2Q14995 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NR1D2Q14995 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NR1D2Q14995 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NR1D2Q14995 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
NR1D2Q14995 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NR1D2Q14995 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NR1D2Q14995 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NR1D2Q14995 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NR1D2Q14995 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NR1D2Q14995 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NR1D2Q14995 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NR1D2Q14995 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NR1D2Q14995 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NR1D2Q14995 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
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