Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

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Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GPNMBQ14956 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GPNMBQ14956 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GPNMBQ14956 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GPNMBQ14956 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GPNMBQ14956 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GPNMBQ14956 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GPNMBQ14956 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GPNMBQ14956 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GPNMBQ14956 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
GPNMBQ14956 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
GPNMBQ14956 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
GPNMBQ14956 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GPNMBQ14956 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GPNMBQ14956 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GPNMBQ14956 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GPNMBQ14956 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GPNMBQ14956 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GPNMBQ14956 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GPNMBQ14956 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GPNMBQ14956 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GPNMBQ14956 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GPNMBQ14956 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GPNMBQ14956 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GPNMBQ14956 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GPNMBQ14956 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GPNMBQ14956 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GPNMBQ14956 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GPNMBQ14956 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GPNMBQ14956 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GPNMBQ14956 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GPNMBQ14956 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GPNMBQ14956 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
GPNMBQ14956 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GPNMBQ14956 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
GPNMBQ14956 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GPNMBQ14956 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GPNMBQ14956 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GPNMBQ14956 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
GPNMBQ14956 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
GPNMBQ14956 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
GPNMBQ14956 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
GPNMBQ14956 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GPNMBQ14956 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GPNMBQ14956 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GPNMBQ14956 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GPNMBQ14956 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GPNMBQ14956 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GPNMBQ14956 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GPNMBQ14956 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GPNMBQ14956 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GPNMBQ14956 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GPNMBQ14956 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GPNMBQ14956 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GPNMBQ14956 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GPNMBQ14956 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GPNMBQ14956 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GPNMBQ14956 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GPNMBQ14956 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GPNMBQ14956 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GPNMBQ14956 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GPNMBQ14956 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GPNMBQ14956 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GPNMBQ14956 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GPNMBQ14956 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GPNMBQ14956 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GPNMBQ14956 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
GPNMBQ14956 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GPNMBQ14956 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GPNMBQ14956 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GPNMBQ14956 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GPNMBQ14956 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GPNMBQ14956 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GPNMBQ14956 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GPNMBQ14956 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GPNMBQ14956 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GPNMBQ14956 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
GPNMBQ14956 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GPNMBQ14956 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GPNMBQ14956 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GPNMBQ14956 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GPNMBQ14956 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GPNMBQ14956 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GPNMBQ14956 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GPNMBQ14956 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GPNMBQ14956 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GPNMBQ14956 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
GPNMBQ14956 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GPNMBQ14956 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GPNMBQ14956 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GPNMBQ14956 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
GPNMBQ14956 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GPNMBQ14956 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GPNMBQ14956 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GPNMBQ14956 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GPNMBQ14956 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GPNMBQ14956 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GPNMBQ14956 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GPNMBQ14956 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GPNMBQ14956 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
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