Protein–RNA interactions for Protein: Q14457

BECN1, Beclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN1Q14457 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BECN1Q14457 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BECN1Q14457 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BECN1Q14457 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BECN1Q14457 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BECN1Q14457 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BECN1Q14457 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BECN1Q14457 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BECN1Q14457 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BECN1Q14457 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BECN1Q14457 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BECN1Q14457 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BECN1Q14457 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BECN1Q14457 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BECN1Q14457 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
BECN1Q14457 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BECN1Q14457 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BECN1Q14457 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BECN1Q14457 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BECN1Q14457 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BECN1Q14457 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BECN1Q14457 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BECN1Q14457 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BECN1Q14457 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BECN1Q14457 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BECN1Q14457 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BECN1Q14457 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BECN1Q14457 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BECN1Q14457 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BECN1Q14457 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BECN1Q14457 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BECN1Q14457 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
BECN1Q14457 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BECN1Q14457 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BECN1Q14457 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BECN1Q14457 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BECN1Q14457 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BECN1Q14457 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BECN1Q14457 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BECN1Q14457 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BECN1Q14457 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BECN1Q14457 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BECN1Q14457 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BECN1Q14457 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BECN1Q14457 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BECN1Q14457 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BECN1Q14457 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BECN1Q14457 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BECN1Q14457 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BECN1Q14457 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BECN1Q14457 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BECN1Q14457 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
BECN1Q14457 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
BECN1Q14457 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BECN1Q14457 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
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BECN1Q14457 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BECN1Q14457 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BECN1Q14457 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BECN1Q14457 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BECN1Q14457 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BECN1Q14457 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BECN1Q14457 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BECN1Q14457 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BECN1Q14457 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BECN1Q14457 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BECN1Q14457 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BECN1Q14457 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BECN1Q14457 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BECN1Q14457 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
BECN1Q14457 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BECN1Q14457 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BECN1Q14457 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BECN1Q14457 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
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BECN1Q14457 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BECN1Q14457 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BECN1Q14457 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BECN1Q14457 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BECN1Q14457 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
BECN1Q14457 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BECN1Q14457 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BECN1Q14457 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
BECN1Q14457 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
BECN1Q14457 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BECN1Q14457 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BECN1Q14457 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BECN1Q14457 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BECN1Q14457 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BECN1Q14457 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BECN1Q14457 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BECN1Q14457 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BECN1Q14457 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BECN1Q14457 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BECN1Q14457 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BECN1Q14457 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BECN1Q14457 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BECN1Q14457 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BECN1Q14457 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BECN1Q14457 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
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