Protein–RNA interactions for Protein: Q13950

RUNX2, Runt-related transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX2Q13950 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RUNX2Q13950 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RUNX2Q13950 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RUNX2Q13950 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RUNX2Q13950 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RUNX2Q13950 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RUNX2Q13950 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RUNX2Q13950 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RUNX2Q13950 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RUNX2Q13950 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RUNX2Q13950 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RUNX2Q13950 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RUNX2Q13950 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RUNX2Q13950 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RUNX2Q13950 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RUNX2Q13950 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RUNX2Q13950 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RUNX2Q13950 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RUNX2Q13950 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RUNX2Q13950 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RUNX2Q13950 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RUNX2Q13950 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RUNX2Q13950 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RUNX2Q13950 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RUNX2Q13950 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RUNX2Q13950 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RUNX2Q13950 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RUNX2Q13950 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RUNX2Q13950 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RUNX2Q13950 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RUNX2Q13950 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RUNX2Q13950 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RUNX2Q13950 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RUNX2Q13950 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RUNX2Q13950 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RUNX2Q13950 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RUNX2Q13950 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RUNX2Q13950 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RUNX2Q13950 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RUNX2Q13950 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RUNX2Q13950 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RUNX2Q13950 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RUNX2Q13950 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RUNX2Q13950 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RUNX2Q13950 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RUNX2Q13950 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RUNX2Q13950 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RUNX2Q13950 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RUNX2Q13950 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RUNX2Q13950 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RUNX2Q13950 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RUNX2Q13950 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RUNX2Q13950 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RUNX2Q13950 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RUNX2Q13950 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RUNX2Q13950 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RUNX2Q13950 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RUNX2Q13950 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RUNX2Q13950 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RUNX2Q13950 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RUNX2Q13950 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RUNX2Q13950 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RUNX2Q13950 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RUNX2Q13950 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RUNX2Q13950 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RUNX2Q13950 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RUNX2Q13950 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RUNX2Q13950 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RUNX2Q13950 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RUNX2Q13950 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RUNX2Q13950 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RUNX2Q13950 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RUNX2Q13950 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RUNX2Q13950 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RUNX2Q13950 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RUNX2Q13950 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RUNX2Q13950 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RUNX2Q13950 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RUNX2Q13950 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RUNX2Q13950 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RUNX2Q13950 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RUNX2Q13950 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RUNX2Q13950 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RUNX2Q13950 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RUNX2Q13950 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RUNX2Q13950 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RUNX2Q13950 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RUNX2Q13950 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RUNX2Q13950 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RUNX2Q13950 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RUNX2Q13950 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RUNX2Q13950 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RUNX2Q13950 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RUNX2Q13950 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RUNX2Q13950 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RUNX2Q13950 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RUNX2Q13950 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RUNX2Q13950 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RUNX2Q13950 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RUNX2Q13950 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms