Protein–RNA interactions for Protein: Q13938

CAPS, Calcyphosin, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPSQ13938 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CAPSQ13938 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CAPSQ13938 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CAPSQ13938 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CAPSQ13938 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CAPSQ13938 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CAPSQ13938 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CAPSQ13938 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CAPSQ13938 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CAPSQ13938 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CAPSQ13938 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CAPSQ13938 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CAPSQ13938 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CAPSQ13938 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CAPSQ13938 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CAPSQ13938 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CAPSQ13938 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CAPSQ13938 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CAPSQ13938 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CAPSQ13938 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CAPSQ13938 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CAPSQ13938 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CAPSQ13938 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CAPSQ13938 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CAPSQ13938 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CAPSQ13938 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CAPSQ13938 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CAPSQ13938 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CAPSQ13938 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CAPSQ13938 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CAPSQ13938 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CAPSQ13938 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CAPSQ13938 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CAPSQ13938 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CAPSQ13938 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CAPSQ13938 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CAPSQ13938 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CAPSQ13938 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CAPSQ13938 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CAPSQ13938 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CAPSQ13938 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CAPSQ13938 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CAPSQ13938 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CAPSQ13938 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CAPSQ13938 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CAPSQ13938 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CAPSQ13938 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CAPSQ13938 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CAPSQ13938 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CAPSQ13938 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CAPSQ13938 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CAPSQ13938 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CAPSQ13938 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CAPSQ13938 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CAPSQ13938 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CAPSQ13938 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CAPSQ13938 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CAPSQ13938 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CAPSQ13938 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CAPSQ13938 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CAPSQ13938 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CAPSQ13938 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CAPSQ13938 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CAPSQ13938 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CAPSQ13938 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CAPSQ13938 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CAPSQ13938 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CAPSQ13938 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CAPSQ13938 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CAPSQ13938 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CAPSQ13938 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CAPSQ13938 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CAPSQ13938 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CAPSQ13938 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CAPSQ13938 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CAPSQ13938 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CAPSQ13938 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CAPSQ13938 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CAPSQ13938 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CAPSQ13938 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CAPSQ13938 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CAPSQ13938 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CAPSQ13938 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CAPSQ13938 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CAPSQ13938 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CAPSQ13938 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CAPSQ13938 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CAPSQ13938 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CAPSQ13938 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CAPSQ13938 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CAPSQ13938 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CAPSQ13938 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CAPSQ13938 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CAPSQ13938 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CAPSQ13938 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CAPSQ13938 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CAPSQ13938 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CAPSQ13938 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CAPSQ13938 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CAPSQ13938 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms