Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
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