Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTCH1Q13635 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTCH1Q13635 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTCH1Q13635 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTCH1Q13635 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTCH1Q13635 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTCH1Q13635 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTCH1Q13635 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTCH1Q13635 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
PTCH1Q13635 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PTCH1Q13635 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PTCH1Q13635 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PTCH1Q13635 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PTCH1Q13635 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PTCH1Q13635 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTCH1Q13635 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTCH1Q13635 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTCH1Q13635 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTCH1Q13635 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTCH1Q13635 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTCH1Q13635 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTCH1Q13635 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTCH1Q13635 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTCH1Q13635 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTCH1Q13635 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTCH1Q13635 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTCH1Q13635 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PTCH1Q13635 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTCH1Q13635 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTCH1Q13635 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTCH1Q13635 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTCH1Q13635 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTCH1Q13635 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTCH1Q13635 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTCH1Q13635 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTCH1Q13635 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTCH1Q13635 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PTCH1Q13635 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PTCH1Q13635 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTCH1Q13635 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTCH1Q13635 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTCH1Q13635 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTCH1Q13635 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTCH1Q13635 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTCH1Q13635 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTCH1Q13635 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTCH1Q13635 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTCH1Q13635 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTCH1Q13635 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTCH1Q13635 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PTCH1Q13635 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTCH1Q13635 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTCH1Q13635 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PTCH1Q13635 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTCH1Q13635 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTCH1Q13635 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTCH1Q13635 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTCH1Q13635 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTCH1Q13635 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTCH1Q13635 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTCH1Q13635 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTCH1Q13635 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTCH1Q13635 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTCH1Q13635 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTCH1Q13635 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTCH1Q13635 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTCH1Q13635 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTCH1Q13635 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTCH1Q13635 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTCH1Q13635 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTCH1Q13635 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTCH1Q13635 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTCH1Q13635 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTCH1Q13635 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PTCH1Q13635 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PTCH1Q13635 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTCH1Q13635 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTCH1Q13635 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTCH1Q13635 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTCH1Q13635 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTCH1Q13635 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTCH1Q13635 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTCH1Q13635 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTCH1Q13635 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTCH1Q13635 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTCH1Q13635 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTCH1Q13635 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTCH1Q13635 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTCH1Q13635 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTCH1Q13635 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PTCH1Q13635 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTCH1Q13635 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PTCH1Q13635 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTCH1Q13635 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTCH1Q13635 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTCH1Q13635 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTCH1Q13635 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTCH1Q13635 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTCH1Q13635 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTCH1Q13635 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
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