Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
ITGB3BPQ13352 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
ITGB3BPQ13352 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ITGB3BPQ13352 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
ITGB3BPQ13352 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ITGB3BPQ13352 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ITGB3BPQ13352 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ITGB3BPQ13352 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ITGB3BPQ13352 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ITGB3BPQ13352 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ITGB3BPQ13352 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ITGB3BPQ13352 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ITGB3BPQ13352 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
ITGB3BPQ13352 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ITGB3BPQ13352 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ITGB3BPQ13352 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ITGB3BPQ13352 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ITGB3BPQ13352 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ITGB3BPQ13352 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ITGB3BPQ13352 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ITGB3BPQ13352 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ITGB3BPQ13352 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ITGB3BPQ13352 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ITGB3BPQ13352 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ITGB3BPQ13352 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ITGB3BPQ13352 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ITGB3BPQ13352 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ITGB3BPQ13352 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
ITGB3BPQ13352 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ITGB3BPQ13352 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ITGB3BPQ13352 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ITGB3BPQ13352 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
ITGB3BPQ13352 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ITGB3BPQ13352 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ITGB3BPQ13352 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
ITGB3BPQ13352 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
ITGB3BPQ13352 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ITGB3BPQ13352 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ITGB3BPQ13352 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ITGB3BPQ13352 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ITGB3BPQ13352 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ITGB3BPQ13352 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ITGB3BPQ13352 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ITGB3BPQ13352 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ITGB3BPQ13352 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ITGB3BPQ13352 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ITGB3BPQ13352 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ITGB3BPQ13352 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ITGB3BPQ13352 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ITGB3BPQ13352 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ITGB3BPQ13352 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ITGB3BPQ13352 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ITGB3BPQ13352 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ITGB3BPQ13352 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ITGB3BPQ13352 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ITGB3BPQ13352 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
ITGB3BPQ13352 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ITGB3BPQ13352 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
ITGB3BPQ13352 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ITGB3BPQ13352 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ITGB3BPQ13352 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ITGB3BPQ13352 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
ITGB3BPQ13352 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ITGB3BPQ13352 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ITGB3BPQ13352 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ITGB3BPQ13352 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ITGB3BPQ13352 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ITGB3BPQ13352 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ITGB3BPQ13352 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ITGB3BPQ13352 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ITGB3BPQ13352 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ITGB3BPQ13352 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ITGB3BPQ13352 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ITGB3BPQ13352 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ITGB3BPQ13352 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ITGB3BPQ13352 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ITGB3BPQ13352 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ITGB3BPQ13352 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ITGB3BPQ13352 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ITGB3BPQ13352 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ITGB3BPQ13352 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ITGB3BPQ13352 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
ITGB3BPQ13352 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ITGB3BPQ13352 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ITGB3BPQ13352 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ITGB3BPQ13352 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
ITGB3BPQ13352 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ITGB3BPQ13352 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ITGB3BPQ13352 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ITGB3BPQ13352 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ITGB3BPQ13352 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ITGB3BPQ13352 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ITGB3BPQ13352 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ITGB3BPQ13352 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ITGB3BPQ13352 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ITGB3BPQ13352 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ITGB3BPQ13352 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ITGB3BPQ13352 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ITGB3BPQ13352 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ITGB3BPQ13352 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms