Protein–RNA interactions for Protein: Q13319

CDK5R2, Cyclin-dependent kinase 5 activator 2, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5R2Q13319 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDK5R2Q13319 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDK5R2Q13319 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDK5R2Q13319 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDK5R2Q13319 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDK5R2Q13319 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CDK5R2Q13319 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDK5R2Q13319 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CDK5R2Q13319 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDK5R2Q13319 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDK5R2Q13319 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDK5R2Q13319 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDK5R2Q13319 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDK5R2Q13319 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDK5R2Q13319 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDK5R2Q13319 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDK5R2Q13319 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDK5R2Q13319 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDK5R2Q13319 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDK5R2Q13319 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDK5R2Q13319 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDK5R2Q13319 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDK5R2Q13319 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDK5R2Q13319 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDK5R2Q13319 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDK5R2Q13319 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDK5R2Q13319 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDK5R2Q13319 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDK5R2Q13319 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDK5R2Q13319 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDK5R2Q13319 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDK5R2Q13319 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDK5R2Q13319 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDK5R2Q13319 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDK5R2Q13319 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDK5R2Q13319 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDK5R2Q13319 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CDK5R2Q13319 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDK5R2Q13319 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDK5R2Q13319 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDK5R2Q13319 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDK5R2Q13319 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDK5R2Q13319 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CDK5R2Q13319 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDK5R2Q13319 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDK5R2Q13319 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CDK5R2Q13319 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDK5R2Q13319 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDK5R2Q13319 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CDK5R2Q13319 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDK5R2Q13319 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDK5R2Q13319 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDK5R2Q13319 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDK5R2Q13319 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDK5R2Q13319 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDK5R2Q13319 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDK5R2Q13319 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDK5R2Q13319 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDK5R2Q13319 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDK5R2Q13319 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDK5R2Q13319 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDK5R2Q13319 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDK5R2Q13319 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDK5R2Q13319 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CDK5R2Q13319 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDK5R2Q13319 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDK5R2Q13319 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDK5R2Q13319 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDK5R2Q13319 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDK5R2Q13319 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDK5R2Q13319 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CDK5R2Q13319 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDK5R2Q13319 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDK5R2Q13319 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDK5R2Q13319 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDK5R2Q13319 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDK5R2Q13319 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDK5R2Q13319 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDK5R2Q13319 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CDK5R2Q13319 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CDK5R2Q13319 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CDK5R2Q13319 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDK5R2Q13319 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDK5R2Q13319 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDK5R2Q13319 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDK5R2Q13319 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDK5R2Q13319 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDK5R2Q13319 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDK5R2Q13319 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDK5R2Q13319 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDK5R2Q13319 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CDK5R2Q13319 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDK5R2Q13319 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDK5R2Q13319 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDK5R2Q13319 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDK5R2Q13319 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDK5R2Q13319 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDK5R2Q13319 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDK5R2Q13319 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDK5R2Q13319 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms