Protein–RNA interactions for Protein: Q13127

REST, RE1-silencing transcription factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,097 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RESTQ13127 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RESTQ13127 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RESTQ13127 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RESTQ13127 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RESTQ13127 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RESTQ13127 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RESTQ13127 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RESTQ13127 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RESTQ13127 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RESTQ13127 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RESTQ13127 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RESTQ13127 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
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RESTQ13127 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RESTQ13127 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RESTQ13127 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RESTQ13127 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RESTQ13127 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
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RESTQ13127 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RESTQ13127 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RESTQ13127 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RESTQ13127 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
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RESTQ13127 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RESTQ13127 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RESTQ13127 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RESTQ13127 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
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RESTQ13127 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
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RESTQ13127 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RESTQ13127 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
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