Protein–RNA interactions for Protein: Q13061

TRDN, Triadin, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDNQ13061 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRDNQ13061 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRDNQ13061 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRDNQ13061 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRDNQ13061 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRDNQ13061 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
TRDNQ13061 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
TRDNQ13061 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRDNQ13061 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRDNQ13061 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRDNQ13061 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRDNQ13061 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRDNQ13061 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRDNQ13061 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRDNQ13061 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRDNQ13061 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRDNQ13061 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRDNQ13061 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRDNQ13061 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRDNQ13061 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRDNQ13061 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRDNQ13061 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRDNQ13061 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRDNQ13061 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRDNQ13061 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRDNQ13061 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRDNQ13061 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRDNQ13061 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRDNQ13061 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRDNQ13061 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC21■□□□□ 0.95
TRDNQ13061 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRDNQ13061 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRDNQ13061 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRDNQ13061 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRDNQ13061 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRDNQ13061 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
TRDNQ13061 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRDNQ13061 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
TRDNQ13061 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TRDNQ13061 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC21■□□□□ 0.95
TRDNQ13061 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC21■□□□□ 0.95
TRDNQ13061 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRDNQ13061 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
TRDNQ13061 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRDNQ13061 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
TRDNQ13061 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TRDNQ13061 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
TRDNQ13061 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
TRDNQ13061 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
TRDNQ13061 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRDNQ13061 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRDNQ13061 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TRDNQ13061 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TRDNQ13061 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRDNQ13061 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRDNQ13061 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRDNQ13061 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRDNQ13061 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRDNQ13061 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRDNQ13061 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
TRDNQ13061 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRDNQ13061 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRDNQ13061 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRDNQ13061 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRDNQ13061 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRDNQ13061 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRDNQ13061 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRDNQ13061 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRDNQ13061 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRDNQ13061 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRDNQ13061 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRDNQ13061 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRDNQ13061 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRDNQ13061 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRDNQ13061 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRDNQ13061 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRDNQ13061 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRDNQ13061 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRDNQ13061 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRDNQ13061 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRDNQ13061 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRDNQ13061 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRDNQ13061 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRDNQ13061 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRDNQ13061 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRDNQ13061 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRDNQ13061 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRDNQ13061 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRDNQ13061 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRDNQ13061 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRDNQ13061 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
TRDNQ13061 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRDNQ13061 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRDNQ13061 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRDNQ13061 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRDNQ13061 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRDNQ13061 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRDNQ13061 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRDNQ13061 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRDNQ13061 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms