Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTP4A2Q12974 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTP4A2Q12974 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTP4A2Q12974 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTP4A2Q12974 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTP4A2Q12974 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTP4A2Q12974 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTP4A2Q12974 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTP4A2Q12974 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTP4A2Q12974 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTP4A2Q12974 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTP4A2Q12974 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTP4A2Q12974 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTP4A2Q12974 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTP4A2Q12974 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTP4A2Q12974 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTP4A2Q12974 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTP4A2Q12974 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTP4A2Q12974 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTP4A2Q12974 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTP4A2Q12974 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTP4A2Q12974 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTP4A2Q12974 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PTP4A2Q12974 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTP4A2Q12974 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTP4A2Q12974 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PTP4A2Q12974 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTP4A2Q12974 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PTP4A2Q12974 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PTP4A2Q12974 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTP4A2Q12974 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PTP4A2Q12974 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTP4A2Q12974 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PTP4A2Q12974 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTP4A2Q12974 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTP4A2Q12974 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTP4A2Q12974 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTP4A2Q12974 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTP4A2Q12974 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTP4A2Q12974 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTP4A2Q12974 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTP4A2Q12974 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTP4A2Q12974 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTP4A2Q12974 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTP4A2Q12974 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTP4A2Q12974 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTP4A2Q12974 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTP4A2Q12974 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTP4A2Q12974 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTP4A2Q12974 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PTP4A2Q12974 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTP4A2Q12974 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTP4A2Q12974 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTP4A2Q12974 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTP4A2Q12974 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTP4A2Q12974 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTP4A2Q12974 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTP4A2Q12974 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTP4A2Q12974 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTP4A2Q12974 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTP4A2Q12974 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTP4A2Q12974 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTP4A2Q12974 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTP4A2Q12974 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
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PTP4A2Q12974 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTP4A2Q12974 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTP4A2Q12974 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTP4A2Q12974 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTP4A2Q12974 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PTP4A2Q12974 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTP4A2Q12974 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTP4A2Q12974 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTP4A2Q12974 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTP4A2Q12974 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTP4A2Q12974 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTP4A2Q12974 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTP4A2Q12974 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTP4A2Q12974 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTP4A2Q12974 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTP4A2Q12974 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTP4A2Q12974 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTP4A2Q12974 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTP4A2Q12974 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTP4A2Q12974 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTP4A2Q12974 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTP4A2Q12974 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTP4A2Q12974 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTP4A2Q12974 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PTP4A2Q12974 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTP4A2Q12974 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTP4A2Q12974 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PTP4A2Q12974 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PTP4A2Q12974 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTP4A2Q12974 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTP4A2Q12974 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTP4A2Q12974 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTP4A2Q12974 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PTP4A2Q12974 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTP4A2Q12974 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
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