Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
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FOXC1Q12948 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXC1Q12948 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXC1Q12948 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXC1Q12948 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXC1Q12948 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXC1Q12948 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXC1Q12948 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXC1Q12948 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXC1Q12948 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXC1Q12948 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXC1Q12948 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXC1Q12948 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXC1Q12948 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXC1Q12948 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXC1Q12948 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXC1Q12948 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXC1Q12948 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXC1Q12948 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXC1Q12948 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXC1Q12948 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXC1Q12948 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXC1Q12948 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXC1Q12948 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXC1Q12948 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
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FOXC1Q12948 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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FOXC1Q12948 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXC1Q12948 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXC1Q12948 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXC1Q12948 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXC1Q12948 AC107982.2-201ENST00000577360 463 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXC1Q12948 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXC1Q12948 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXC1Q12948 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXC1Q12948 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXC1Q12948 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXC1Q12948 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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FOXC1Q12948 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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FOXC1Q12948 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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FOXC1Q12948 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXC1Q12948 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXC1Q12948 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
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FOXC1Q12948 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
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FOXC1Q12948 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXC1Q12948 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXC1Q12948 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
FOXC1Q12948 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
FOXC1Q12948 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
FOXC1Q12948 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
FOXC1Q12948 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
FOXC1Q12948 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
FOXC1Q12948 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
FOXC1Q12948 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
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