Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

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Length 1,464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
GRIN2AQ12879 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
GRIN2AQ12879 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
GRIN2AQ12879 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
GRIN2AQ12879 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
GRIN2AQ12879 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
GRIN2AQ12879 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
GRIN2AQ12879 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
GRIN2AQ12879 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
GRIN2AQ12879 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
GRIN2AQ12879 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
GRIN2AQ12879 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
GRIN2AQ12879 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
GRIN2AQ12879 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
GRIN2AQ12879 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GRIN2AQ12879 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
GRIN2AQ12879 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
GRIN2AQ12879 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GRIN2AQ12879 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
GRIN2AQ12879 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GRIN2AQ12879 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC28.24■■■□□ 2.11
GRIN2AQ12879 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
GRIN2AQ12879 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
GRIN2AQ12879 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
GRIN2AQ12879 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GRIN2AQ12879 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
GRIN2AQ12879 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
GRIN2AQ12879 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
GRIN2AQ12879 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GRIN2AQ12879 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GRIN2AQ12879 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GRIN2AQ12879 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
GRIN2AQ12879 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
GRIN2AQ12879 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GRIN2AQ12879 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
GRIN2AQ12879 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
GRIN2AQ12879 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
GRIN2AQ12879 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
GRIN2AQ12879 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
GRIN2AQ12879 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GRIN2AQ12879 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GRIN2AQ12879 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
GRIN2AQ12879 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
GRIN2AQ12879 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GRIN2AQ12879 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
GRIN2AQ12879 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
GRIN2AQ12879 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
GRIN2AQ12879 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
GRIN2AQ12879 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GRIN2AQ12879 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GRIN2AQ12879 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GRIN2AQ12879 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GRIN2AQ12879 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
GRIN2AQ12879 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
GRIN2AQ12879 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
GRIN2AQ12879 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
GRIN2AQ12879 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
GRIN2AQ12879 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
GRIN2AQ12879 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
GRIN2AQ12879 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
GRIN2AQ12879 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
GRIN2AQ12879 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
GRIN2AQ12879 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
GRIN2AQ12879 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
GRIN2AQ12879 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
GRIN2AQ12879 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GRIN2AQ12879 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GRIN2AQ12879 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GRIN2AQ12879 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GRIN2AQ12879 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
GRIN2AQ12879 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GRIN2AQ12879 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
GRIN2AQ12879 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GRIN2AQ12879 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GRIN2AQ12879 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GRIN2AQ12879 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GRIN2AQ12879 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GRIN2AQ12879 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GRIN2AQ12879 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
GRIN2AQ12879 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GRIN2AQ12879 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GRIN2AQ12879 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GRIN2AQ12879 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GRIN2AQ12879 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GRIN2AQ12879 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GRIN2AQ12879 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GRIN2AQ12879 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GRIN2AQ12879 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GRIN2AQ12879 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GRIN2AQ12879 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GRIN2AQ12879 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GRIN2AQ12879 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
GRIN2AQ12879 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GRIN2AQ12879 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GRIN2AQ12879 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
GRIN2AQ12879 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.11
GRIN2AQ12879 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
GRIN2AQ12879 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
GRIN2AQ12879 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
GRIN2AQ12879 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
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