Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
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KCNMA1Q12791 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KCNMA1Q12791 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KCNMA1Q12791 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCNMA1Q12791 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCNMA1Q12791 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
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KCNMA1Q12791 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCNMA1Q12791 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCNMA1Q12791 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
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KCNMA1Q12791 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
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KCNMA1Q12791 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCNMA1Q12791 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
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KCNMA1Q12791 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCNMA1Q12791 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
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KCNMA1Q12791 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCNMA1Q12791 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
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KCNMA1Q12791 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
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KCNMA1Q12791 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KCNMA1Q12791 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KCNMA1Q12791 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KCNMA1Q12791 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
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KCNMA1Q12791 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KCNMA1Q12791 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
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KCNMA1Q12791 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
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KCNMA1Q12791 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KCNMA1Q12791 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KCNMA1Q12791 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KCNMA1Q12791 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KCNMA1Q12791 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
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KCNMA1Q12791 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KCNMA1Q12791 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KCNMA1Q12791 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KCNMA1Q12791 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KCNMA1Q12791 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KCNMA1Q12791 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KCNMA1Q12791 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
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