Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXO1Q12778 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.3 ms