Protein–RNA interactions for Protein: Q12770

SCAP, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPQ12770 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCAPQ12770 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SCAPQ12770 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SCAPQ12770 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCAPQ12770 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCAPQ12770 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCAPQ12770 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCAPQ12770 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCAPQ12770 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCAPQ12770 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCAPQ12770 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCAPQ12770 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCAPQ12770 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCAPQ12770 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCAPQ12770 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCAPQ12770 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCAPQ12770 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCAPQ12770 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCAPQ12770 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCAPQ12770 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCAPQ12770 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCAPQ12770 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCAPQ12770 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCAPQ12770 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCAPQ12770 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCAPQ12770 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCAPQ12770 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCAPQ12770 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCAPQ12770 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCAPQ12770 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCAPQ12770 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCAPQ12770 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCAPQ12770 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCAPQ12770 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SCAPQ12770 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCAPQ12770 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCAPQ12770 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCAPQ12770 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCAPQ12770 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCAPQ12770 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCAPQ12770 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCAPQ12770 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCAPQ12770 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCAPQ12770 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SCAPQ12770 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCAPQ12770 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SCAPQ12770 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCAPQ12770 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCAPQ12770 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCAPQ12770 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCAPQ12770 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCAPQ12770 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCAPQ12770 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCAPQ12770 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCAPQ12770 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCAPQ12770 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCAPQ12770 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCAPQ12770 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCAPQ12770 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCAPQ12770 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCAPQ12770 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCAPQ12770 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCAPQ12770 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCAPQ12770 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SCAPQ12770 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SCAPQ12770 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCAPQ12770 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SCAPQ12770 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCAPQ12770 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCAPQ12770 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SCAPQ12770 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SCAPQ12770 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCAPQ12770 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCAPQ12770 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCAPQ12770 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCAPQ12770 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCAPQ12770 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCAPQ12770 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCAPQ12770 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCAPQ12770 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCAPQ12770 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCAPQ12770 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCAPQ12770 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCAPQ12770 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCAPQ12770 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCAPQ12770 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCAPQ12770 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCAPQ12770 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCAPQ12770 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SCAPQ12770 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCAPQ12770 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SCAPQ12770 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SCAPQ12770 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SCAPQ12770 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SCAPQ12770 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCAPQ12770 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCAPQ12770 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SCAPQ12770 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCAPQ12770 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCAPQ12770 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
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