Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms