Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FMODQ06828 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FMODQ06828 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FMODQ06828 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FMODQ06828 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FMODQ06828 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FMODQ06828 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FMODQ06828 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FMODQ06828 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FMODQ06828 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FMODQ06828 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FMODQ06828 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FMODQ06828 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
FMODQ06828 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FMODQ06828 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FMODQ06828 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FMODQ06828 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FMODQ06828 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FMODQ06828 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FMODQ06828 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FMODQ06828 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FMODQ06828 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FMODQ06828 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FMODQ06828 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FMODQ06828 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FMODQ06828 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FMODQ06828 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FMODQ06828 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FMODQ06828 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FMODQ06828 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FMODQ06828 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FMODQ06828 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FMODQ06828 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FMODQ06828 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FMODQ06828 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FMODQ06828 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FMODQ06828 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FMODQ06828 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FMODQ06828 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FMODQ06828 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FMODQ06828 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FMODQ06828 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FMODQ06828 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FMODQ06828 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FMODQ06828 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FMODQ06828 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FMODQ06828 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FMODQ06828 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FMODQ06828 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FMODQ06828 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FMODQ06828 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FMODQ06828 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FMODQ06828 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FMODQ06828 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FMODQ06828 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FMODQ06828 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FMODQ06828 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FMODQ06828 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FMODQ06828 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FMODQ06828 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FMODQ06828 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FMODQ06828 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FMODQ06828 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FMODQ06828 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FMODQ06828 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
FMODQ06828 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FMODQ06828 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FMODQ06828 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FMODQ06828 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FMODQ06828 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FMODQ06828 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
FMODQ06828 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FMODQ06828 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FMODQ06828 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FMODQ06828 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FMODQ06828 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FMODQ06828 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FMODQ06828 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FMODQ06828 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FMODQ06828 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FMODQ06828 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FMODQ06828 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
FMODQ06828 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FMODQ06828 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FMODQ06828 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FMODQ06828 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FMODQ06828 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FMODQ06828 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FMODQ06828 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FMODQ06828 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FMODQ06828 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FMODQ06828 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FMODQ06828 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FMODQ06828 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FMODQ06828 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FMODQ06828 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
FMODQ06828 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FMODQ06828 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
FMODQ06828 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
FMODQ06828 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms