Protein–RNA interactions for Protein: Q05586

GRIN1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, humanhuman

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN1Q05586 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GRIN1Q05586 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GRIN1Q05586 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GRIN1Q05586 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GRIN1Q05586 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GRIN1Q05586 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GRIN1Q05586 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GRIN1Q05586 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GRIN1Q05586 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GRIN1Q05586 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GRIN1Q05586 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GRIN1Q05586 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GRIN1Q05586 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GRIN1Q05586 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
GRIN1Q05586 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GRIN1Q05586 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GRIN1Q05586 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GRIN1Q05586 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
GRIN1Q05586 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GRIN1Q05586 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
GRIN1Q05586 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GRIN1Q05586 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GRIN1Q05586 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GRIN1Q05586 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GRIN1Q05586 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
GRIN1Q05586 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GRIN1Q05586 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GRIN1Q05586 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GRIN1Q05586 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GRIN1Q05586 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GRIN1Q05586 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GRIN1Q05586 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GRIN1Q05586 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GRIN1Q05586 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GRIN1Q05586 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GRIN1Q05586 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GRIN1Q05586 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GRIN1Q05586 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GRIN1Q05586 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GRIN1Q05586 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GRIN1Q05586 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GRIN1Q05586 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GRIN1Q05586 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GRIN1Q05586 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GRIN1Q05586 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GRIN1Q05586 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GRIN1Q05586 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GRIN1Q05586 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GRIN1Q05586 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GRIN1Q05586 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GRIN1Q05586 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GRIN1Q05586 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GRIN1Q05586 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
GRIN1Q05586 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GRIN1Q05586 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GRIN1Q05586 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GRIN1Q05586 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GRIN1Q05586 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GRIN1Q05586 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
GRIN1Q05586 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GRIN1Q05586 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GRIN1Q05586 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GRIN1Q05586 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GRIN1Q05586 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GRIN1Q05586 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GRIN1Q05586 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GRIN1Q05586 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GRIN1Q05586 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GRIN1Q05586 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GRIN1Q05586 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GRIN1Q05586 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GRIN1Q05586 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GRIN1Q05586 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GRIN1Q05586 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GRIN1Q05586 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GRIN1Q05586 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
GRIN1Q05586 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GRIN1Q05586 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GRIN1Q05586 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GRIN1Q05586 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GRIN1Q05586 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
GRIN1Q05586 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
GRIN1Q05586 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GRIN1Q05586 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GRIN1Q05586 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GRIN1Q05586 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GRIN1Q05586 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GRIN1Q05586 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GRIN1Q05586 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GRIN1Q05586 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GRIN1Q05586 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GRIN1Q05586 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GRIN1Q05586 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
GRIN1Q05586 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GRIN1Q05586 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GRIN1Q05586 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GRIN1Q05586 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GRIN1Q05586 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GRIN1Q05586 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GRIN1Q05586 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms