Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GBE1Q04446 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GBE1Q04446 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GBE1Q04446 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GBE1Q04446 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GBE1Q04446 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GBE1Q04446 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GBE1Q04446 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GBE1Q04446 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GBE1Q04446 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GBE1Q04446 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GBE1Q04446 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GBE1Q04446 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GBE1Q04446 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GBE1Q04446 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GBE1Q04446 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GBE1Q04446 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GBE1Q04446 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GBE1Q04446 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GBE1Q04446 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GBE1Q04446 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GBE1Q04446 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GBE1Q04446 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GBE1Q04446 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GBE1Q04446 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GBE1Q04446 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GBE1Q04446 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GBE1Q04446 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GBE1Q04446 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GBE1Q04446 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GBE1Q04446 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GBE1Q04446 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GBE1Q04446 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GBE1Q04446 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GBE1Q04446 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GBE1Q04446 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GBE1Q04446 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GBE1Q04446 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GBE1Q04446 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GBE1Q04446 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GBE1Q04446 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GBE1Q04446 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GBE1Q04446 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GBE1Q04446 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GBE1Q04446 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GBE1Q04446 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GBE1Q04446 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GBE1Q04446 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GBE1Q04446 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GBE1Q04446 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GBE1Q04446 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GBE1Q04446 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GBE1Q04446 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GBE1Q04446 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GBE1Q04446 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GBE1Q04446 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GBE1Q04446 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GBE1Q04446 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GBE1Q04446 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GBE1Q04446 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GBE1Q04446 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GBE1Q04446 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GBE1Q04446 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GBE1Q04446 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GBE1Q04446 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GBE1Q04446 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GBE1Q04446 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GBE1Q04446 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GBE1Q04446 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GBE1Q04446 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GBE1Q04446 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GBE1Q04446 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GBE1Q04446 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
GBE1Q04446 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
GBE1Q04446 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
GBE1Q04446 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GBE1Q04446 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GBE1Q04446 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GBE1Q04446 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GBE1Q04446 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GBE1Q04446 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GBE1Q04446 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GBE1Q04446 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
GBE1Q04446 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GBE1Q04446 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GBE1Q04446 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GBE1Q04446 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GBE1Q04446 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GBE1Q04446 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GBE1Q04446 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GBE1Q04446 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GBE1Q04446 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GBE1Q04446 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GBE1Q04446 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GBE1Q04446 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GBE1Q04446 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GBE1Q04446 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GBE1Q04446 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GBE1Q04446 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GBE1Q04446 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms