Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DSC2Q02487 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
DSC2Q02487 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DSC2Q02487 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DSC2Q02487 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DSC2Q02487 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DSC2Q02487 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DSC2Q02487 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
DSC2Q02487 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DSC2Q02487 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DSC2Q02487 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DSC2Q02487 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DSC2Q02487 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DSC2Q02487 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DSC2Q02487 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DSC2Q02487 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DSC2Q02487 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DSC2Q02487 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DSC2Q02487 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DSC2Q02487 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DSC2Q02487 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DSC2Q02487 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DSC2Q02487 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DSC2Q02487 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DSC2Q02487 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DSC2Q02487 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DSC2Q02487 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DSC2Q02487 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DSC2Q02487 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DSC2Q02487 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DSC2Q02487 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DSC2Q02487 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DSC2Q02487 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DSC2Q02487 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DSC2Q02487 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DSC2Q02487 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DSC2Q02487 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DSC2Q02487 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DSC2Q02487 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DSC2Q02487 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DSC2Q02487 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DSC2Q02487 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DSC2Q02487 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DSC2Q02487 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DSC2Q02487 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DSC2Q02487 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
DSC2Q02487 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DSC2Q02487 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DSC2Q02487 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DSC2Q02487 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DSC2Q02487 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DSC2Q02487 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DSC2Q02487 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DSC2Q02487 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DSC2Q02487 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DSC2Q02487 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DSC2Q02487 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DSC2Q02487 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DSC2Q02487 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DSC2Q02487 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DSC2Q02487 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DSC2Q02487 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DSC2Q02487 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DSC2Q02487 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
DSC2Q02487 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DSC2Q02487 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DSC2Q02487 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DSC2Q02487 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DSC2Q02487 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DSC2Q02487 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DSC2Q02487 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DSC2Q02487 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DSC2Q02487 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DSC2Q02487 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DSC2Q02487 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DSC2Q02487 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DSC2Q02487 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DSC2Q02487 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DSC2Q02487 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DSC2Q02487 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DSC2Q02487 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DSC2Q02487 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DSC2Q02487 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DSC2Q02487 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
DSC2Q02487 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DSC2Q02487 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DSC2Q02487 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DSC2Q02487 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DSC2Q02487 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DSC2Q02487 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DSC2Q02487 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DSC2Q02487 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
DSC2Q02487 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
DSC2Q02487 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DSC2Q02487 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DSC2Q02487 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DSC2Q02487 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DSC2Q02487 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DSC2Q02487 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DSC2Q02487 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.1 ms