Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CENPEQ02224 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CENPEQ02224 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CENPEQ02224 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CENPEQ02224 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CENPEQ02224 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CENPEQ02224 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CENPEQ02224 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CENPEQ02224 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CENPEQ02224 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CENPEQ02224 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CENPEQ02224 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms