Protein–RNA interactions for Protein: Q01850

CDR2, Cerebellar degeneration-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDR2Q01850 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDR2Q01850 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDR2Q01850 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDR2Q01850 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDR2Q01850 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDR2Q01850 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDR2Q01850 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDR2Q01850 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDR2Q01850 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDR2Q01850 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDR2Q01850 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDR2Q01850 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDR2Q01850 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDR2Q01850 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDR2Q01850 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CDR2Q01850 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDR2Q01850 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDR2Q01850 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDR2Q01850 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDR2Q01850 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDR2Q01850 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDR2Q01850 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDR2Q01850 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDR2Q01850 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDR2Q01850 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CDR2Q01850 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDR2Q01850 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDR2Q01850 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDR2Q01850 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDR2Q01850 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDR2Q01850 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDR2Q01850 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDR2Q01850 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDR2Q01850 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDR2Q01850 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDR2Q01850 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDR2Q01850 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDR2Q01850 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDR2Q01850 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDR2Q01850 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDR2Q01850 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDR2Q01850 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDR2Q01850 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDR2Q01850 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDR2Q01850 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDR2Q01850 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDR2Q01850 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDR2Q01850 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDR2Q01850 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDR2Q01850 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDR2Q01850 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDR2Q01850 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDR2Q01850 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDR2Q01850 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CDR2Q01850 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDR2Q01850 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CDR2Q01850 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDR2Q01850 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDR2Q01850 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDR2Q01850 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDR2Q01850 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDR2Q01850 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDR2Q01850 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDR2Q01850 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDR2Q01850 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDR2Q01850 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDR2Q01850 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDR2Q01850 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDR2Q01850 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDR2Q01850 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CDR2Q01850 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDR2Q01850 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CDR2Q01850 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDR2Q01850 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDR2Q01850 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDR2Q01850 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDR2Q01850 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDR2Q01850 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDR2Q01850 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDR2Q01850 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDR2Q01850 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CDR2Q01850 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CDR2Q01850 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDR2Q01850 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDR2Q01850 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDR2Q01850 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDR2Q01850 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDR2Q01850 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDR2Q01850 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDR2Q01850 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDR2Q01850 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDR2Q01850 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDR2Q01850 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDR2Q01850 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDR2Q01850 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDR2Q01850 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDR2Q01850 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDR2Q01850 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDR2Q01850 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDR2Q01850 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms