Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MDM2Q00987 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MDM2Q00987 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MDM2Q00987 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MDM2Q00987 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MDM2Q00987 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
MDM2Q00987 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MDM2Q00987 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MDM2Q00987 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MDM2Q00987 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MDM2Q00987 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MDM2Q00987 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MDM2Q00987 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MDM2Q00987 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MDM2Q00987 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MDM2Q00987 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MDM2Q00987 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MDM2Q00987 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
MDM2Q00987 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
MDM2Q00987 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
MDM2Q00987 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MDM2Q00987 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MDM2Q00987 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MDM2Q00987 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MDM2Q00987 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MDM2Q00987 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MDM2Q00987 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MDM2Q00987 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MDM2Q00987 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MDM2Q00987 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MDM2Q00987 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MDM2Q00987 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MDM2Q00987 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MDM2Q00987 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MDM2Q00987 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MDM2Q00987 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MDM2Q00987 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MDM2Q00987 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MDM2Q00987 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MDM2Q00987 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MDM2Q00987 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MDM2Q00987 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MDM2Q00987 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MDM2Q00987 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MDM2Q00987 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
MDM2Q00987 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MDM2Q00987 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MDM2Q00987 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MDM2Q00987 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MDM2Q00987 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MDM2Q00987 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MDM2Q00987 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MDM2Q00987 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
MDM2Q00987 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MDM2Q00987 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
MDM2Q00987 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
MDM2Q00987 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MDM2Q00987 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MDM2Q00987 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
MDM2Q00987 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MDM2Q00987 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MDM2Q00987 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
MDM2Q00987 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MDM2Q00987 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MDM2Q00987 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
MDM2Q00987 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MDM2Q00987 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MDM2Q00987 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MDM2Q00987 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MDM2Q00987 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MDM2Q00987 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
MDM2Q00987 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MDM2Q00987 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MDM2Q00987 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MDM2Q00987 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MDM2Q00987 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MDM2Q00987 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MDM2Q00987 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
MDM2Q00987 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
MDM2Q00987 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MDM2Q00987 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
MDM2Q00987 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MDM2Q00987 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MDM2Q00987 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MDM2Q00987 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MDM2Q00987 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MDM2Q00987 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MDM2Q00987 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MDM2Q00987 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MDM2Q00987 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MDM2Q00987 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MDM2Q00987 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MDM2Q00987 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MDM2Q00987 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MDM2Q00987 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MDM2Q00987 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MDM2Q00987 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MDM2Q00987 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MDM2Q00987 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MDM2Q00987 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms