Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CLTCQ00610 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLTCQ00610 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLTCQ00610 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLTCQ00610 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLTCQ00610 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLTCQ00610 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLTCQ00610 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLTCQ00610 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLTCQ00610 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLTCQ00610 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLTCQ00610 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLTCQ00610 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CLTCQ00610 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLTCQ00610 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLTCQ00610 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLTCQ00610 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLTCQ00610 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLTCQ00610 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLTCQ00610 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLTCQ00610 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLTCQ00610 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLTCQ00610 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLTCQ00610 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLTCQ00610 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLTCQ00610 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLTCQ00610 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLTCQ00610 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CLTCQ00610 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CLTCQ00610 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CLTCQ00610 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CLTCQ00610 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
CLTCQ00610 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
CLTCQ00610 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CLTCQ00610 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
CLTCQ00610 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CLTCQ00610 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CLTCQ00610 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CLTCQ00610 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CLTCQ00610 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CLTCQ00610 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLTCQ00610 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLTCQ00610 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLTCQ00610 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLTCQ00610 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLTCQ00610 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CLTCQ00610 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CLTCQ00610 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLTCQ00610 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLTCQ00610 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLTCQ00610 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLTCQ00610 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLTCQ00610 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLTCQ00610 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLTCQ00610 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLTCQ00610 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLTCQ00610 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLTCQ00610 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLTCQ00610 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLTCQ00610 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CLTCQ00610 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CLTCQ00610 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLTCQ00610 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLTCQ00610 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLTCQ00610 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLTCQ00610 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLTCQ00610 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLTCQ00610 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLTCQ00610 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLTCQ00610 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLTCQ00610 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLTCQ00610 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLTCQ00610 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLTCQ00610 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CLTCQ00610 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLTCQ00610 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLTCQ00610 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLTCQ00610 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLTCQ00610 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLTCQ00610 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CLTCQ00610 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLTCQ00610 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLTCQ00610 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLTCQ00610 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLTCQ00610 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLTCQ00610 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLTCQ00610 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLTCQ00610 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLTCQ00610 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLTCQ00610 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLTCQ00610 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLTCQ00610 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLTCQ00610 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLTCQ00610 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLTCQ00610 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLTCQ00610 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLTCQ00610 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLTCQ00610 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CLTCQ00610 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLTCQ00610 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms