Protein–RNA interactions for Protein: P98155

VLDLR, Very low-density lipoprotein receptor, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VLDLRP98155 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VLDLRP98155 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VLDLRP98155 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VLDLRP98155 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VLDLRP98155 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VLDLRP98155 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VLDLRP98155 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VLDLRP98155 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VLDLRP98155 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VLDLRP98155 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VLDLRP98155 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VLDLRP98155 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VLDLRP98155 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VLDLRP98155 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VLDLRP98155 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VLDLRP98155 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VLDLRP98155 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VLDLRP98155 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VLDLRP98155 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VLDLRP98155 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VLDLRP98155 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
VLDLRP98155 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VLDLRP98155 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VLDLRP98155 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VLDLRP98155 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VLDLRP98155 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VLDLRP98155 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VLDLRP98155 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VLDLRP98155 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VLDLRP98155 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VLDLRP98155 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VLDLRP98155 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VLDLRP98155 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VLDLRP98155 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VLDLRP98155 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VLDLRP98155 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VLDLRP98155 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VLDLRP98155 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VLDLRP98155 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VLDLRP98155 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VLDLRP98155 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VLDLRP98155 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VLDLRP98155 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VLDLRP98155 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VLDLRP98155 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VLDLRP98155 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VLDLRP98155 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VLDLRP98155 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VLDLRP98155 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VLDLRP98155 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VLDLRP98155 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VLDLRP98155 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VLDLRP98155 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VLDLRP98155 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VLDLRP98155 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VLDLRP98155 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VLDLRP98155 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VLDLRP98155 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VLDLRP98155 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VLDLRP98155 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VLDLRP98155 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VLDLRP98155 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VLDLRP98155 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VLDLRP98155 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VLDLRP98155 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VLDLRP98155 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VLDLRP98155 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VLDLRP98155 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VLDLRP98155 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VLDLRP98155 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VLDLRP98155 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VLDLRP98155 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VLDLRP98155 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VLDLRP98155 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VLDLRP98155 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VLDLRP98155 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
VLDLRP98155 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
VLDLRP98155 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VLDLRP98155 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VLDLRP98155 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VLDLRP98155 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VLDLRP98155 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VLDLRP98155 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VLDLRP98155 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VLDLRP98155 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VLDLRP98155 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VLDLRP98155 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VLDLRP98155 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VLDLRP98155 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VLDLRP98155 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VLDLRP98155 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VLDLRP98155 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VLDLRP98155 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VLDLRP98155 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
VLDLRP98155 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VLDLRP98155 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VLDLRP98155 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VLDLRP98155 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
VLDLRP98155 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VLDLRP98155 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms