Protein–RNA interactions for Protein: P62330

ARF6, ADP-ribosylation factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF6P62330 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ARF6P62330 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ARF6P62330 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ARF6P62330 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ARF6P62330 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ARF6P62330 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ARF6P62330 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ARF6P62330 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ARF6P62330 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ARF6P62330 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ARF6P62330 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ARF6P62330 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ARF6P62330 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ARF6P62330 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ARF6P62330 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ARF6P62330 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ARF6P62330 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ARF6P62330 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ARF6P62330 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ARF6P62330 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ARF6P62330 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ARF6P62330 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ARF6P62330 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ARF6P62330 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ARF6P62330 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ARF6P62330 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ARF6P62330 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ARF6P62330 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ARF6P62330 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ARF6P62330 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ARF6P62330 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ARF6P62330 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ARF6P62330 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ARF6P62330 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
ARF6P62330 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ARF6P62330 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ARF6P62330 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ARF6P62330 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ARF6P62330 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
ARF6P62330 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ARF6P62330 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ARF6P62330 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ARF6P62330 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ARF6P62330 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ARF6P62330 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ARF6P62330 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ARF6P62330 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ARF6P62330 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ARF6P62330 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ARF6P62330 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
ARF6P62330 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ARF6P62330 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ARF6P62330 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ARF6P62330 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ARF6P62330 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ARF6P62330 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ARF6P62330 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ARF6P62330 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ARF6P62330 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ARF6P62330 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ARF6P62330 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ARF6P62330 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ARF6P62330 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ARF6P62330 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ARF6P62330 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ARF6P62330 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ARF6P62330 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ARF6P62330 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ARF6P62330 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ARF6P62330 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ARF6P62330 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ARF6P62330 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ARF6P62330 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ARF6P62330 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ARF6P62330 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ARF6P62330 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ARF6P62330 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ARF6P62330 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ARF6P62330 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ARF6P62330 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ARF6P62330 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ARF6P62330 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ARF6P62330 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ARF6P62330 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ARF6P62330 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ARF6P62330 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ARF6P62330 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ARF6P62330 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ARF6P62330 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ARF6P62330 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ARF6P62330 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ARF6P62330 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ARF6P62330 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ARF6P62330 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ARF6P62330 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ARF6P62330 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ARF6P62330 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ARF6P62330 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ARF6P62330 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ARF6P62330 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms