Protein–RNA interactions for Protein: P55211

CASP9, Caspase-9, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9P55211 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CASP9P55211 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CASP9P55211 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CASP9P55211 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP9P55211 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP9P55211 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP9P55211 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP9P55211 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP9P55211 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP9P55211 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP9P55211 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP9P55211 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP9P55211 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP9P55211 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP9P55211 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP9P55211 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP9P55211 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP9P55211 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP9P55211 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP9P55211 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP9P55211 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP9P55211 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP9P55211 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP9P55211 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP9P55211 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP9P55211 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP9P55211 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP9P55211 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP9P55211 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP9P55211 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP9P55211 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP9P55211 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP9P55211 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP9P55211 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP9P55211 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP9P55211 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP9P55211 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP9P55211 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP9P55211 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP9P55211 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP9P55211 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP9P55211 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP9P55211 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP9P55211 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP9P55211 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP9P55211 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP9P55211 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP9P55211 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP9P55211 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP9P55211 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP9P55211 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP9P55211 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP9P55211 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP9P55211 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP9P55211 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP9P55211 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP9P55211 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP9P55211 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP9P55211 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP9P55211 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP9P55211 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP9P55211 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP9P55211 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP9P55211 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP9P55211 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP9P55211 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP9P55211 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP9P55211 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP9P55211 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP9P55211 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP9P55211 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP9P55211 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP9P55211 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP9P55211 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP9P55211 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP9P55211 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP9P55211 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP9P55211 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP9P55211 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP9P55211 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP9P55211 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP9P55211 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP9P55211 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP9P55211 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP9P55211 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP9P55211 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP9P55211 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP9P55211 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP9P55211 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP9P55211 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP9P55211 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP9P55211 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP9P55211 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP9P55211 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP9P55211 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP9P55211 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP9P55211 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP9P55211 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP9P55211 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP9P55211 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms