Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
NESP48681 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
NESP48681 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
NESP48681 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
NESP48681 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
NESP48681 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
NESP48681 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
NESP48681 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
NESP48681 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC30.15■■■□□ 2.42
NESP48681 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
NESP48681 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
NESP48681 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
NESP48681 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
NESP48681 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
NESP48681 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
NESP48681 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
NESP48681 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
NESP48681 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
NESP48681 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
NESP48681 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
NESP48681 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
NESP48681 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
NESP48681 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
NESP48681 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
NESP48681 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
NESP48681 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
NESP48681 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
NESP48681 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
NESP48681 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
NESP48681 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
NESP48681 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
NESP48681 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
NESP48681 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
NESP48681 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
NESP48681 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
NESP48681 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
NESP48681 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.41
NESP48681 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.41
NESP48681 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.41
NESP48681 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
NESP48681 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.41
NESP48681 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.41
NESP48681 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
NESP48681 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
NESP48681 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
NESP48681 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC30.13■■■□□ 2.41
NESP48681 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
NESP48681 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
NESP48681 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
NESP48681 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
NESP48681 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
NESP48681 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
NESP48681 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
NESP48681 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
NESP48681 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
NESP48681 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
NESP48681 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
NESP48681 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
NESP48681 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC30.12■■■□□ 2.41
NESP48681 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
NESP48681 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
NESP48681 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
NESP48681 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
NESP48681 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
NESP48681 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
NESP48681 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
NESP48681 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
NESP48681 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
NESP48681 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
NESP48681 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
NESP48681 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
NESP48681 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
NESP48681 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
NESP48681 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
NESP48681 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
NESP48681 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
NESP48681 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
NESP48681 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
NESP48681 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
NESP48681 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
NESP48681 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
NESP48681 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
NESP48681 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
NESP48681 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
NESP48681 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
NESP48681 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
NESP48681 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
NESP48681 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
NESP48681 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
NESP48681 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
NESP48681 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
NESP48681 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
NESP48681 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
NESP48681 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
NESP48681 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
NESP48681 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
NESP48681 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
NESP48681 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
NESP48681 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC30.1■■■□□ 2.41
NESP48681 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms