Protein–RNA interactions for Protein: P45974

USP5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP5P45974 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP5P45974 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP5P45974 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
USP5P45974 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP5P45974 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP5P45974 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP5P45974 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP5P45974 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP5P45974 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP5P45974 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP5P45974 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP5P45974 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP5P45974 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP5P45974 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP5P45974 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP5P45974 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP5P45974 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP5P45974 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP5P45974 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP5P45974 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP5P45974 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP5P45974 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
USP5P45974 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP5P45974 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP5P45974 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP5P45974 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
USP5P45974 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
USP5P45974 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP5P45974 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP5P45974 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP5P45974 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP5P45974 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP5P45974 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP5P45974 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP5P45974 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
USP5P45974 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
USP5P45974 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
USP5P45974 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
USP5P45974 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
USP5P45974 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
USP5P45974 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
USP5P45974 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
USP5P45974 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
USP5P45974 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
USP5P45974 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
USP5P45974 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
USP5P45974 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
USP5P45974 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
USP5P45974 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
USP5P45974 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
USP5P45974 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
USP5P45974 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
USP5P45974 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
USP5P45974 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
USP5P45974 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
USP5P45974 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
USP5P45974 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
USP5P45974 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
USP5P45974 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
USP5P45974 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
USP5P45974 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
USP5P45974 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
USP5P45974 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
USP5P45974 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
USP5P45974 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
USP5P45974 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
USP5P45974 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
USP5P45974 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
USP5P45974 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
USP5P45974 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
USP5P45974 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
USP5P45974 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
USP5P45974 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
USP5P45974 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
USP5P45974 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
USP5P45974 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
USP5P45974 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
USP5P45974 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
USP5P45974 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
USP5P45974 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
USP5P45974 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
USP5P45974 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
USP5P45974 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
USP5P45974 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
USP5P45974 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
USP5P45974 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
USP5P45974 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
USP5P45974 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
USP5P45974 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
USP5P45974 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
USP5P45974 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
USP5P45974 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
USP5P45974 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
USP5P45974 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
USP5P45974 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
USP5P45974 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
USP5P45974 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
USP5P45974 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
USP5P45974 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
USP5P45974 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms