Protein–RNA interactions for Protein: P37198

NUP62, Nuclear pore glycoprotein p62, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP62P37198 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NUP62P37198 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NUP62P37198 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NUP62P37198 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NUP62P37198 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NUP62P37198 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NUP62P37198 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NUP62P37198 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NUP62P37198 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NUP62P37198 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NUP62P37198 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NUP62P37198 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NUP62P37198 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NUP62P37198 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NUP62P37198 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NUP62P37198 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NUP62P37198 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NUP62P37198 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NUP62P37198 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NUP62P37198 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NUP62P37198 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NUP62P37198 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NUP62P37198 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
NUP62P37198 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NUP62P37198 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NUP62P37198 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NUP62P37198 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
NUP62P37198 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NUP62P37198 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NUP62P37198 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NUP62P37198 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NUP62P37198 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NUP62P37198 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NUP62P37198 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NUP62P37198 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NUP62P37198 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NUP62P37198 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
NUP62P37198 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NUP62P37198 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NUP62P37198 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
NUP62P37198 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NUP62P37198 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
NUP62P37198 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NUP62P37198 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NUP62P37198 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
NUP62P37198 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NUP62P37198 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NUP62P37198 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NUP62P37198 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NUP62P37198 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NUP62P37198 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NUP62P37198 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NUP62P37198 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NUP62P37198 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NUP62P37198 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NUP62P37198 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NUP62P37198 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NUP62P37198 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NUP62P37198 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NUP62P37198 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NUP62P37198 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NUP62P37198 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NUP62P37198 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NUP62P37198 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
NUP62P37198 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NUP62P37198 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
NUP62P37198 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
NUP62P37198 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
NUP62P37198 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
NUP62P37198 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
NUP62P37198 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NUP62P37198 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
NUP62P37198 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
NUP62P37198 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NUP62P37198 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
NUP62P37198 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC15.02■□□□□ -0
NUP62P37198 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
NUP62P37198 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NUP62P37198 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
NUP62P37198 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
NUP62P37198 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
NUP62P37198 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
NUP62P37198 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
NUP62P37198 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
NUP62P37198 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC15.02■□□□□ -0
NUP62P37198 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC15.02■□□□□ -0
NUP62P37198 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
NUP62P37198 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
NUP62P37198 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
NUP62P37198 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NUP62P37198 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NUP62P37198 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NUP62P37198 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
NUP62P37198 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NUP62P37198 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NUP62P37198 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NUP62P37198 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NUP62P37198 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NUP62P37198 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NUP62P37198 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms