Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF2E1P29083 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF2E1P29083 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF2E1P29083 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF2E1P29083 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF2E1P29083 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF2E1P29083 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF2E1P29083 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF2E1P29083 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF2E1P29083 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF2E1P29083 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF2E1P29083 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF2E1P29083 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF2E1P29083 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF2E1P29083 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF2E1P29083 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF2E1P29083 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF2E1P29083 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF2E1P29083 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF2E1P29083 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF2E1P29083 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF2E1P29083 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF2E1P29083 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF2E1P29083 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF2E1P29083 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF2E1P29083 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF2E1P29083 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF2E1P29083 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF2E1P29083 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF2E1P29083 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF2E1P29083 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF2E1P29083 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF2E1P29083 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF2E1P29083 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GTF2E1P29083 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GTF2E1P29083 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GTF2E1P29083 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GTF2E1P29083 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GTF2E1P29083 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GTF2E1P29083 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GTF2E1P29083 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GTF2E1P29083 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GTF2E1P29083 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
GTF2E1P29083 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
GTF2E1P29083 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GTF2E1P29083 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
GTF2E1P29083 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GTF2E1P29083 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GTF2E1P29083 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GTF2E1P29083 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GTF2E1P29083 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GTF2E1P29083 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GTF2E1P29083 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GTF2E1P29083 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GTF2E1P29083 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GTF2E1P29083 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GTF2E1P29083 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GTF2E1P29083 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTF2E1P29083 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTF2E1P29083 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTF2E1P29083 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTF2E1P29083 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTF2E1P29083 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTF2E1P29083 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTF2E1P29083 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTF2E1P29083 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTF2E1P29083 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTF2E1P29083 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTF2E1P29083 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTF2E1P29083 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTF2E1P29083 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GTF2E1P29083 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTF2E1P29083 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTF2E1P29083 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GTF2E1P29083 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTF2E1P29083 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTF2E1P29083 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTF2E1P29083 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTF2E1P29083 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTF2E1P29083 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTF2E1P29083 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GTF2E1P29083 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GTF2E1P29083 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GTF2E1P29083 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GTF2E1P29083 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GTF2E1P29083 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GTF2E1P29083 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GTF2E1P29083 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GTF2E1P29083 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GTF2E1P29083 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GTF2E1P29083 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GTF2E1P29083 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GTF2E1P29083 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GTF2E1P29083 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GTF2E1P29083 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GTF2E1P29083 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GTF2E1P29083 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GTF2E1P29083 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GTF2E1P29083 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GTF2E1P29083 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms