Protein–RNA interactions for Protein: P28702

RXRB, Retinoic acid receptor RXR-beta, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RXRBP28702 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RXRBP28702 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RXRBP28702 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RXRBP28702 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RXRBP28702 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RXRBP28702 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RXRBP28702 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RXRBP28702 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RXRBP28702 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RXRBP28702 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RXRBP28702 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RXRBP28702 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RXRBP28702 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RXRBP28702 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RXRBP28702 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RXRBP28702 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RXRBP28702 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RXRBP28702 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RXRBP28702 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RXRBP28702 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RXRBP28702 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RXRBP28702 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RXRBP28702 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RXRBP28702 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RXRBP28702 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RXRBP28702 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RXRBP28702 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RXRBP28702 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RXRBP28702 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RXRBP28702 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RXRBP28702 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RXRBP28702 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RXRBP28702 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RXRBP28702 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RXRBP28702 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RXRBP28702 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RXRBP28702 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RXRBP28702 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RXRBP28702 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RXRBP28702 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RXRBP28702 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RXRBP28702 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RXRBP28702 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RXRBP28702 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RXRBP28702 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RXRBP28702 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RXRBP28702 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RXRBP28702 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RXRBP28702 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RXRBP28702 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RXRBP28702 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RXRBP28702 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RXRBP28702 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RXRBP28702 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RXRBP28702 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RXRBP28702 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RXRBP28702 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RXRBP28702 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RXRBP28702 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RXRBP28702 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RXRBP28702 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RXRBP28702 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RXRBP28702 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RXRBP28702 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RXRBP28702 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RXRBP28702 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RXRBP28702 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RXRBP28702 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RXRBP28702 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RXRBP28702 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RXRBP28702 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RXRBP28702 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RXRBP28702 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RXRBP28702 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RXRBP28702 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RXRBP28702 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RXRBP28702 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RXRBP28702 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RXRBP28702 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RXRBP28702 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RXRBP28702 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RXRBP28702 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RXRBP28702 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RXRBP28702 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RXRBP28702 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RXRBP28702 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RXRBP28702 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RXRBP28702 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RXRBP28702 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RXRBP28702 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RXRBP28702 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
RXRBP28702 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RXRBP28702 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RXRBP28702 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RXRBP28702 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RXRBP28702 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RXRBP28702 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RXRBP28702 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RXRBP28702 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RXRBP28702 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms