Protein–RNA interactions for Protein: P21709

EPHA1, Ephrin type-A receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA1P21709 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 AC012183.1-201ENST00000625197 499 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms