Protein–RNA interactions for Protein: P19113

HDC, Histidine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDCP19113 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HDCP19113 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HDCP19113 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HDCP19113 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HDCP19113 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HDCP19113 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HDCP19113 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HDCP19113 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HDCP19113 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HDCP19113 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HDCP19113 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HDCP19113 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HDCP19113 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HDCP19113 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HDCP19113 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HDCP19113 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HDCP19113 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HDCP19113 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HDCP19113 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HDCP19113 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HDCP19113 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HDCP19113 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HDCP19113 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HDCP19113 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HDCP19113 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HDCP19113 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HDCP19113 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HDCP19113 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HDCP19113 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HDCP19113 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HDCP19113 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HDCP19113 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HDCP19113 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HDCP19113 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HDCP19113 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDCP19113 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDCP19113 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDCP19113 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDCP19113 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDCP19113 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDCP19113 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDCP19113 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDCP19113 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDCP19113 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDCP19113 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDCP19113 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDCP19113 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDCP19113 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDCP19113 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDCP19113 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDCP19113 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HDCP19113 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDCP19113 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDCP19113 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDCP19113 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDCP19113 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDCP19113 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HDCP19113 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDCP19113 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDCP19113 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDCP19113 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDCP19113 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDCP19113 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDCP19113 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDCP19113 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDCP19113 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDCP19113 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDCP19113 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDCP19113 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDCP19113 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDCP19113 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDCP19113 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDCP19113 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HDCP19113 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HDCP19113 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HDCP19113 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HDCP19113 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HDCP19113 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HDCP19113 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HDCP19113 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HDCP19113 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HDCP19113 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HDCP19113 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HDCP19113 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HDCP19113 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HDCP19113 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HDCP19113 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HDCP19113 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HDCP19113 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HDCP19113 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HDCP19113 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HDCP19113 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HDCP19113 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HDCP19113 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HDCP19113 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HDCP19113 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HDCP19113 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HDCP19113 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HDCP19113 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HDCP19113 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms