Protein–RNA interactions for Protein: P18858

LIG1, DNA ligase 1, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIG1P18858 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LIG1P18858 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LIG1P18858 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LIG1P18858 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LIG1P18858 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LIG1P18858 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LIG1P18858 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LIG1P18858 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LIG1P18858 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LIG1P18858 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LIG1P18858 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LIG1P18858 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LIG1P18858 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LIG1P18858 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LIG1P18858 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LIG1P18858 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LIG1P18858 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LIG1P18858 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LIG1P18858 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LIG1P18858 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
LIG1P18858 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LIG1P18858 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LIG1P18858 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LIG1P18858 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LIG1P18858 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LIG1P18858 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LIG1P18858 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
LIG1P18858 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LIG1P18858 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
LIG1P18858 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
LIG1P18858 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
LIG1P18858 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
LIG1P18858 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
LIG1P18858 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
LIG1P18858 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LIG1P18858 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LIG1P18858 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LIG1P18858 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LIG1P18858 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LIG1P18858 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LIG1P18858 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LIG1P18858 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LIG1P18858 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LIG1P18858 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
LIG1P18858 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
LIG1P18858 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LIG1P18858 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LIG1P18858 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LIG1P18858 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LIG1P18858 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LIG1P18858 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LIG1P18858 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LIG1P18858 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
LIG1P18858 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LIG1P18858 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LIG1P18858 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LIG1P18858 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LIG1P18858 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LIG1P18858 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LIG1P18858 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LIG1P18858 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LIG1P18858 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LIG1P18858 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LIG1P18858 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LIG1P18858 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LIG1P18858 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LIG1P18858 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LIG1P18858 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LIG1P18858 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LIG1P18858 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LIG1P18858 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LIG1P18858 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
LIG1P18858 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LIG1P18858 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LIG1P18858 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LIG1P18858 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LIG1P18858 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LIG1P18858 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LIG1P18858 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LIG1P18858 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LIG1P18858 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LIG1P18858 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LIG1P18858 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LIG1P18858 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LIG1P18858 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LIG1P18858 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LIG1P18858 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LIG1P18858 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
LIG1P18858 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LIG1P18858 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LIG1P18858 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LIG1P18858 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LIG1P18858 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LIG1P18858 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LIG1P18858 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LIG1P18858 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LIG1P18858 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LIG1P18858 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LIG1P18858 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LIG1P18858 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms