Protein–RNA interactions for Protein: P17036

ZNF3, Zinc finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF3P17036 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF3P17036 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF3P17036 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF3P17036 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF3P17036 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF3P17036 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF3P17036 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF3P17036 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF3P17036 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF3P17036 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF3P17036 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF3P17036 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF3P17036 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF3P17036 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF3P17036 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF3P17036 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF3P17036 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF3P17036 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF3P17036 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF3P17036 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF3P17036 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF3P17036 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF3P17036 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF3P17036 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF3P17036 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF3P17036 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF3P17036 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF3P17036 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF3P17036 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF3P17036 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF3P17036 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF3P17036 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF3P17036 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF3P17036 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF3P17036 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF3P17036 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF3P17036 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF3P17036 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF3P17036 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF3P17036 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF3P17036 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF3P17036 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF3P17036 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF3P17036 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF3P17036 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF3P17036 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF3P17036 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF3P17036 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF3P17036 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF3P17036 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF3P17036 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF3P17036 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF3P17036 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF3P17036 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF3P17036 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF3P17036 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ZNF3P17036 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF3P17036 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF3P17036 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF3P17036 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF3P17036 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF3P17036 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF3P17036 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF3P17036 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF3P17036 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ZNF3P17036 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF3P17036 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF3P17036 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF3P17036 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF3P17036 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF3P17036 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF3P17036 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ZNF3P17036 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF3P17036 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF3P17036 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ZNF3P17036 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF3P17036 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF3P17036 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF3P17036 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF3P17036 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF3P17036 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF3P17036 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF3P17036 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF3P17036 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF3P17036 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF3P17036 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF3P17036 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF3P17036 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF3P17036 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF3P17036 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF3P17036 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF3P17036 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF3P17036 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF3P17036 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF3P17036 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF3P17036 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF3P17036 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF3P17036 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF3P17036 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF3P17036 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms