Protein–RNA interactions for Protein: P16520

GNB3, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB3P16520 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GNB3P16520 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GNB3P16520 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GNB3P16520 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GNB3P16520 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GNB3P16520 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GNB3P16520 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GNB3P16520 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GNB3P16520 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GNB3P16520 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GNB3P16520 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GNB3P16520 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GNB3P16520 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GNB3P16520 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GNB3P16520 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
GNB3P16520 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GNB3P16520 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GNB3P16520 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GNB3P16520 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GNB3P16520 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GNB3P16520 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GNB3P16520 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GNB3P16520 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GNB3P16520 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GNB3P16520 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GNB3P16520 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GNB3P16520 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GNB3P16520 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GNB3P16520 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GNB3P16520 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GNB3P16520 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GNB3P16520 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GNB3P16520 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GNB3P16520 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GNB3P16520 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GNB3P16520 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GNB3P16520 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GNB3P16520 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GNB3P16520 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GNB3P16520 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
GNB3P16520 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GNB3P16520 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GNB3P16520 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GNB3P16520 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GNB3P16520 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GNB3P16520 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GNB3P16520 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GNB3P16520 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GNB3P16520 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GNB3P16520 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GNB3P16520 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GNB3P16520 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GNB3P16520 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GNB3P16520 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GNB3P16520 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
GNB3P16520 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GNB3P16520 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GNB3P16520 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GNB3P16520 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GNB3P16520 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GNB3P16520 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GNB3P16520 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GNB3P16520 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GNB3P16520 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GNB3P16520 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GNB3P16520 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GNB3P16520 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GNB3P16520 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
GNB3P16520 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GNB3P16520 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GNB3P16520 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
GNB3P16520 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GNB3P16520 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GNB3P16520 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GNB3P16520 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GNB3P16520 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
GNB3P16520 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GNB3P16520 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
GNB3P16520 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
GNB3P16520 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GNB3P16520 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GNB3P16520 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GNB3P16520 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GNB3P16520 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
GNB3P16520 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
GNB3P16520 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GNB3P16520 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GNB3P16520 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GNB3P16520 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GNB3P16520 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GNB3P16520 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GNB3P16520 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GNB3P16520 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GNB3P16520 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GNB3P16520 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GNB3P16520 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GNB3P16520 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GNB3P16520 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GNB3P16520 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GNB3P16520 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms