Protein–RNA interactions for Protein: P13500

CCL2, C-C motif chemokine 2, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL2P13500 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL2P13500 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL2P13500 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL2P13500 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL2P13500 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL2P13500 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL2P13500 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL2P13500 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL2P13500 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL2P13500 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL2P13500 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL2P13500 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL2P13500 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL2P13500 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL2P13500 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL2P13500 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL2P13500 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL2P13500 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL2P13500 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL2P13500 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL2P13500 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL2P13500 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL2P13500 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL2P13500 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL2P13500 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL2P13500 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL2P13500 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL2P13500 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL2P13500 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL2P13500 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL2P13500 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL2P13500 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL2P13500 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL2P13500 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL2P13500 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL2P13500 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL2P13500 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL2P13500 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL2P13500 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL2P13500 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL2P13500 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL2P13500 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL2P13500 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL2P13500 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL2P13500 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL2P13500 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL2P13500 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL2P13500 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL2P13500 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL2P13500 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL2P13500 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL2P13500 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL2P13500 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL2P13500 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL2P13500 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL2P13500 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL2P13500 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL2P13500 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL2P13500 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL2P13500 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL2P13500 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL2P13500 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL2P13500 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL2P13500 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL2P13500 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL2P13500 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL2P13500 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL2P13500 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL2P13500 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL2P13500 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL2P13500 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL2P13500 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL2P13500 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL2P13500 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL2P13500 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL2P13500 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL2P13500 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL2P13500 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL2P13500 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL2P13500 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL2P13500 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL2P13500 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL2P13500 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL2P13500 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL2P13500 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL2P13500 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL2P13500 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL2P13500 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL2P13500 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL2P13500 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL2P13500 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL2P13500 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL2P13500 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL2P13500 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL2P13500 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL2P13500 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL2P13500 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL2P13500 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL2P13500 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL2P13500 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms