Protein–RNA interactions for Protein: P10072

HKR1, Krueppel-related zinc finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HKR1P10072 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HKR1P10072 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HKR1P10072 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
HKR1P10072 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HKR1P10072 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
HKR1P10072 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HKR1P10072 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
HKR1P10072 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HKR1P10072 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HKR1P10072 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HKR1P10072 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HKR1P10072 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HKR1P10072 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HKR1P10072 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HKR1P10072 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HKR1P10072 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HKR1P10072 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HKR1P10072 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HKR1P10072 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HKR1P10072 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HKR1P10072 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HKR1P10072 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HKR1P10072 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HKR1P10072 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HKR1P10072 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HKR1P10072 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HKR1P10072 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HKR1P10072 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HKR1P10072 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HKR1P10072 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HKR1P10072 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HKR1P10072 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HKR1P10072 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HKR1P10072 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HKR1P10072 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HKR1P10072 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HKR1P10072 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HKR1P10072 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
HKR1P10072 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HKR1P10072 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HKR1P10072 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HKR1P10072 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HKR1P10072 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HKR1P10072 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HKR1P10072 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HKR1P10072 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HKR1P10072 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HKR1P10072 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HKR1P10072 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HKR1P10072 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HKR1P10072 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HKR1P10072 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HKR1P10072 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
HKR1P10072 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HKR1P10072 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HKR1P10072 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
HKR1P10072 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HKR1P10072 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HKR1P10072 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HKR1P10072 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
HKR1P10072 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC15.02■□□□□ -0
HKR1P10072 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HKR1P10072 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
HKR1P10072 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HKR1P10072 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HKR1P10072 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HKR1P10072 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
HKR1P10072 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HKR1P10072 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HKR1P10072 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
HKR1P10072 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
HKR1P10072 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
HKR1P10072 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HKR1P10072 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HKR1P10072 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
HKR1P10072 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HKR1P10072 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.02■□□□□ -0
HKR1P10072 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC15.02■□□□□ -0
HKR1P10072 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.02■□□□□ -0
HKR1P10072 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
HKR1P10072 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
HKR1P10072 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HKR1P10072 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HKR1P10072 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC15.02■□□□□ -0
HKR1P10072 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HKR1P10072 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
HKR1P10072 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HKR1P10072 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HKR1P10072 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HKR1P10072 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HKR1P10072 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HKR1P10072 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
HKR1P10072 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HKR1P10072 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
HKR1P10072 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HKR1P10072 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
HKR1P10072 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HKR1P10072 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HKR1P10072 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HKR1P10072 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms