Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GLI3P10071 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GLI3P10071 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GLI3P10071 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GLI3P10071 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GLI3P10071 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GLI3P10071 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
GLI3P10071 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GLI3P10071 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GLI3P10071 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GLI3P10071 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GLI3P10071 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GLI3P10071 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GLI3P10071 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GLI3P10071 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
GLI3P10071 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GLI3P10071 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GLI3P10071 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GLI3P10071 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GLI3P10071 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GLI3P10071 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GLI3P10071 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
GLI3P10071 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GLI3P10071 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GLI3P10071 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
GLI3P10071 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GLI3P10071 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GLI3P10071 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GLI3P10071 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GLI3P10071 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
GLI3P10071 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GLI3P10071 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GLI3P10071 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GLI3P10071 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GLI3P10071 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GLI3P10071 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GLI3P10071 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GLI3P10071 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GLI3P10071 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GLI3P10071 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
GLI3P10071 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
GLI3P10071 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
GLI3P10071 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
GLI3P10071 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GLI3P10071 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GLI3P10071 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GLI3P10071 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
GLI3P10071 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GLI3P10071 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
GLI3P10071 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GLI3P10071 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GLI3P10071 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GLI3P10071 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GLI3P10071 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GLI3P10071 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GLI3P10071 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
GLI3P10071 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GLI3P10071 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
GLI3P10071 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GLI3P10071 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GLI3P10071 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GLI3P10071 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GLI3P10071 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GLI3P10071 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GLI3P10071 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GLI3P10071 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GLI3P10071 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GLI3P10071 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GLI3P10071 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GLI3P10071 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GLI3P10071 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GLI3P10071 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GLI3P10071 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
GLI3P10071 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GLI3P10071 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GLI3P10071 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GLI3P10071 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
GLI3P10071 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GLI3P10071 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
GLI3P10071 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GLI3P10071 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GLI3P10071 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GLI3P10071 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GLI3P10071 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GLI3P10071 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GLI3P10071 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GLI3P10071 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GLI3P10071 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GLI3P10071 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
GLI3P10071 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GLI3P10071 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GLI3P10071 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GLI3P10071 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GLI3P10071 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GLI3P10071 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GLI3P10071 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GLI3P10071 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GLI3P10071 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
GLI3P10071 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
GLI3P10071 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms