Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD8

PGA3, Pepsin A-3, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGA3P0DJD8 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
PGA3P0DJD8 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
PGA3P0DJD8 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PGA3P0DJD8 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PGA3P0DJD8 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
PGA3P0DJD8 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PGA3P0DJD8 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
PGA3P0DJD8 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PGA3P0DJD8 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PGA3P0DJD8 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PGA3P0DJD8 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PGA3P0DJD8 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PGA3P0DJD8 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PGA3P0DJD8 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PGA3P0DJD8 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PGA3P0DJD8 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PGA3P0DJD8 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PGA3P0DJD8 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PGA3P0DJD8 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PGA3P0DJD8 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PGA3P0DJD8 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PGA3P0DJD8 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PGA3P0DJD8 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PGA3P0DJD8 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PGA3P0DJD8 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PGA3P0DJD8 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PGA3P0DJD8 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PGA3P0DJD8 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PGA3P0DJD8 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PGA3P0DJD8 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PGA3P0DJD8 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PGA3P0DJD8 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PGA3P0DJD8 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PGA3P0DJD8 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PGA3P0DJD8 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PGA3P0DJD8 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PGA3P0DJD8 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PGA3P0DJD8 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PGA3P0DJD8 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PGA3P0DJD8 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PGA3P0DJD8 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PGA3P0DJD8 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PGA3P0DJD8 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PGA3P0DJD8 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PGA3P0DJD8 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PGA3P0DJD8 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PGA3P0DJD8 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PGA3P0DJD8 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PGA3P0DJD8 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PGA3P0DJD8 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PGA3P0DJD8 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PGA3P0DJD8 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PGA3P0DJD8 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PGA3P0DJD8 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PGA3P0DJD8 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PGA3P0DJD8 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PGA3P0DJD8 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PGA3P0DJD8 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PGA3P0DJD8 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PGA3P0DJD8 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PGA3P0DJD8 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PGA3P0DJD8 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
PGA3P0DJD8 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PGA3P0DJD8 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
PGA3P0DJD8 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PGA3P0DJD8 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PGA3P0DJD8 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PGA3P0DJD8 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PGA3P0DJD8 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
PGA3P0DJD8 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PGA3P0DJD8 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PGA3P0DJD8 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
PGA3P0DJD8 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PGA3P0DJD8 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PGA3P0DJD8 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms