Protein–RNA interactions for Protein: P0DI82

TRAPPC2B, Trafficking protein particle complex subunit 2B, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2BP0DI82 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRAPPC2BP0DI82 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TRAPPC2BP0DI82 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRAPPC2BP0DI82 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRAPPC2BP0DI82 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRAPPC2BP0DI82 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRAPPC2BP0DI82 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRAPPC2BP0DI82 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRAPPC2BP0DI82 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRAPPC2BP0DI82 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRAPPC2BP0DI82 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRAPPC2BP0DI82 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRAPPC2BP0DI82 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRAPPC2BP0DI82 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
TRAPPC2BP0DI82 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRAPPC2BP0DI82 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRAPPC2BP0DI82 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRAPPC2BP0DI82 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRAPPC2BP0DI82 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRAPPC2BP0DI82 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRAPPC2BP0DI82 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRAPPC2BP0DI82 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRAPPC2BP0DI82 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRAPPC2BP0DI82 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAPPC2BP0DI82 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAPPC2BP0DI82 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAPPC2BP0DI82 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAPPC2BP0DI82 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAPPC2BP0DI82 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAPPC2BP0DI82 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAPPC2BP0DI82 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAPPC2BP0DI82 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAPPC2BP0DI82 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAPPC2BP0DI82 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAPPC2BP0DI82 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAPPC2BP0DI82 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAPPC2BP0DI82 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAPPC2BP0DI82 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAPPC2BP0DI82 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAPPC2BP0DI82 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAPPC2BP0DI82 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAPPC2BP0DI82 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAPPC2BP0DI82 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAPPC2BP0DI82 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAPPC2BP0DI82 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAPPC2BP0DI82 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAPPC2BP0DI82 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAPPC2BP0DI82 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAPPC2BP0DI82 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAPPC2BP0DI82 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAPPC2BP0DI82 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAPPC2BP0DI82 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAPPC2BP0DI82 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAPPC2BP0DI82 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAPPC2BP0DI82 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAPPC2BP0DI82 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAPPC2BP0DI82 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAPPC2BP0DI82 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAPPC2BP0DI82 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAPPC2BP0DI82 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAPPC2BP0DI82 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAPPC2BP0DI82 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAPPC2BP0DI82 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAPPC2BP0DI82 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAPPC2BP0DI82 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAPPC2BP0DI82 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAPPC2BP0DI82 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAPPC2BP0DI82 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAPPC2BP0DI82 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAPPC2BP0DI82 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAPPC2BP0DI82 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAPPC2BP0DI82 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAPPC2BP0DI82 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAPPC2BP0DI82 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAPPC2BP0DI82 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAPPC2BP0DI82 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAPPC2BP0DI82 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAPPC2BP0DI82 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAPPC2BP0DI82 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAPPC2BP0DI82 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAPPC2BP0DI82 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAPPC2BP0DI82 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAPPC2BP0DI82 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAPPC2BP0DI82 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAPPC2BP0DI82 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAPPC2BP0DI82 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAPPC2BP0DI82 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAPPC2BP0DI82 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAPPC2BP0DI82 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAPPC2BP0DI82 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAPPC2BP0DI82 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAPPC2BP0DI82 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAPPC2BP0DI82 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAPPC2BP0DI82 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAPPC2BP0DI82 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAPPC2BP0DI82 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAPPC2BP0DI82 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAPPC2BP0DI82 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAPPC2BP0DI82 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAPPC2BP0DI82 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms