Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L5

C4B, Complement C4-B, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BP0C0L5 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C4BP0C0L5 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C4BP0C0L5 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C4BP0C0L5 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C4BP0C0L5 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C4BP0C0L5 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C4BP0C0L5 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C4BP0C0L5 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C4BP0C0L5 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
C4BP0C0L5 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C4BP0C0L5 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C4BP0C0L5 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C4BP0C0L5 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C4BP0C0L5 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C4BP0C0L5 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C4BP0C0L5 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C4BP0C0L5 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C4BP0C0L5 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C4BP0C0L5 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C4BP0C0L5 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C4BP0C0L5 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C4BP0C0L5 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C4BP0C0L5 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C4BP0C0L5 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C4BP0C0L5 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
C4BP0C0L5 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
C4BP0C0L5 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C4BP0C0L5 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
C4BP0C0L5 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
C4BP0C0L5 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
C4BP0C0L5 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
C4BP0C0L5 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
C4BP0C0L5 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
C4BP0C0L5 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C4BP0C0L5 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C4BP0C0L5 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C4BP0C0L5 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C4BP0C0L5 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C4BP0C0L5 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C4BP0C0L5 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
C4BP0C0L5 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
C4BP0C0L5 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
C4BP0C0L5 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C4BP0C0L5 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C4BP0C0L5 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C4BP0C0L5 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C4BP0C0L5 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C4BP0C0L5 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C4BP0C0L5 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C4BP0C0L5 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C4BP0C0L5 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C4BP0C0L5 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C4BP0C0L5 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C4BP0C0L5 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C4BP0C0L5 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C4BP0C0L5 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C4BP0C0L5 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C4BP0C0L5 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C4BP0C0L5 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C4BP0C0L5 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C4BP0C0L5 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C4BP0C0L5 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C4BP0C0L5 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C4BP0C0L5 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C4BP0C0L5 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C4BP0C0L5 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C4BP0C0L5 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C4BP0C0L5 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C4BP0C0L5 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C4BP0C0L5 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C4BP0C0L5 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C4BP0C0L5 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C4BP0C0L5 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C4BP0C0L5 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C4BP0C0L5 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C4BP0C0L5 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C4BP0C0L5 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C4BP0C0L5 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C4BP0C0L5 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C4BP0C0L5 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
C4BP0C0L5 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C4BP0C0L5 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
C4BP0C0L5 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
C4BP0C0L5 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C4BP0C0L5 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C4BP0C0L5 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
C4BP0C0L5 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C4BP0C0L5 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
C4BP0C0L5 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C4BP0C0L5 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C4BP0C0L5 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C4BP0C0L5 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
C4BP0C0L5 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C4BP0C0L5 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C4BP0C0L5 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C4BP0C0L5 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C4BP0C0L5 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C4BP0C0L5 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C4BP0C0L5 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C4BP0C0L5 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
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