Protein–RNA interactions for Protein: P04216

THY1, Thy-1 membrane glycoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THY1P04216 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
THY1P04216 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
THY1P04216 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
THY1P04216 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
THY1P04216 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
THY1P04216 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
THY1P04216 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
THY1P04216 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
THY1P04216 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
THY1P04216 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
THY1P04216 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
THY1P04216 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
THY1P04216 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
THY1P04216 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
THY1P04216 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
THY1P04216 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
THY1P04216 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
THY1P04216 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
THY1P04216 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
THY1P04216 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
THY1P04216 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
THY1P04216 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
THY1P04216 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
THY1P04216 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
THY1P04216 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
THY1P04216 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
THY1P04216 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
THY1P04216 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
THY1P04216 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
THY1P04216 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
THY1P04216 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
THY1P04216 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
THY1P04216 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
THY1P04216 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
THY1P04216 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
THY1P04216 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
THY1P04216 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
THY1P04216 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
THY1P04216 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
THY1P04216 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
THY1P04216 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
THY1P04216 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
THY1P04216 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
THY1P04216 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
THY1P04216 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
THY1P04216 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
THY1P04216 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
THY1P04216 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
THY1P04216 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
THY1P04216 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
THY1P04216 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
THY1P04216 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
THY1P04216 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
THY1P04216 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
THY1P04216 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
THY1P04216 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
THY1P04216 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
THY1P04216 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
THY1P04216 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
THY1P04216 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
THY1P04216 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
THY1P04216 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
THY1P04216 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
THY1P04216 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
THY1P04216 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
THY1P04216 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
THY1P04216 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
THY1P04216 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
THY1P04216 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
THY1P04216 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
THY1P04216 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
THY1P04216 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
THY1P04216 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
THY1P04216 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
THY1P04216 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
THY1P04216 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
THY1P04216 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
THY1P04216 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
THY1P04216 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
THY1P04216 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
THY1P04216 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
THY1P04216 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
THY1P04216 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
THY1P04216 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
THY1P04216 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
THY1P04216 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
THY1P04216 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
THY1P04216 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
THY1P04216 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
THY1P04216 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
THY1P04216 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
THY1P04216 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
THY1P04216 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
THY1P04216 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
THY1P04216 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
THY1P04216 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
THY1P04216 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
THY1P04216 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
THY1P04216 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
THY1P04216 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms