Protein–RNA interactions for Protein: P02647

APOA1, Apolipoprotein A-I, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA1P02647 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOA1P02647 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOA1P02647 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOA1P02647 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOA1P02647 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOA1P02647 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOA1P02647 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOA1P02647 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOA1P02647 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
APOA1P02647 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOA1P02647 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
APOA1P02647 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
APOA1P02647 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
APOA1P02647 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
APOA1P02647 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
APOA1P02647 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
APOA1P02647 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOA1P02647 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOA1P02647 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOA1P02647 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOA1P02647 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOA1P02647 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
APOA1P02647 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOA1P02647 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
APOA1P02647 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOA1P02647 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOA1P02647 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOA1P02647 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOA1P02647 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOA1P02647 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOA1P02647 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOA1P02647 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOA1P02647 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOA1P02647 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOA1P02647 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOA1P02647 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOA1P02647 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOA1P02647 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOA1P02647 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOA1P02647 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
APOA1P02647 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOA1P02647 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOA1P02647 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOA1P02647 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOA1P02647 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
APOA1P02647 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOA1P02647 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOA1P02647 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
APOA1P02647 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
APOA1P02647 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOA1P02647 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOA1P02647 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOA1P02647 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOA1P02647 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOA1P02647 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOA1P02647 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOA1P02647 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOA1P02647 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOA1P02647 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOA1P02647 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOA1P02647 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOA1P02647 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOA1P02647 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOA1P02647 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOA1P02647 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOA1P02647 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOA1P02647 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOA1P02647 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOA1P02647 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOA1P02647 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOA1P02647 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
APOA1P02647 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
APOA1P02647 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOA1P02647 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOA1P02647 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
APOA1P02647 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOA1P02647 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOA1P02647 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOA1P02647 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOA1P02647 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOA1P02647 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOA1P02647 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOA1P02647 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOA1P02647 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOA1P02647 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOA1P02647 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOA1P02647 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOA1P02647 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOA1P02647 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOA1P02647 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOA1P02647 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOA1P02647 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOA1P02647 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOA1P02647 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOA1P02647 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOA1P02647 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
APOA1P02647 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
APOA1P02647 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
APOA1P02647 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
APOA1P02647 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms