Protein–RNA interactions for Protein: P01857

IGHG1, Immunoglobulin heavy constant gamma 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHG1P01857 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGHG1P01857 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGHG1P01857 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGHG1P01857 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGHG1P01857 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGHG1P01857 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGHG1P01857 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGHG1P01857 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGHG1P01857 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGHG1P01857 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IGHG1P01857 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IGHG1P01857 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IGHG1P01857 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IGHG1P01857 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IGHG1P01857 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IGHG1P01857 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IGHG1P01857 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IGHG1P01857 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IGHG1P01857 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IGHG1P01857 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IGHG1P01857 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IGHG1P01857 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IGHG1P01857 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IGHG1P01857 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IGHG1P01857 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IGHG1P01857 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IGHG1P01857 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IGHG1P01857 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IGHG1P01857 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
IGHG1P01857 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IGHG1P01857 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IGHG1P01857 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
IGHG1P01857 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IGHG1P01857 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IGHG1P01857 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
IGHG1P01857 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IGHG1P01857 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IGHG1P01857 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IGHG1P01857 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IGHG1P01857 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IGHG1P01857 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
IGHG1P01857 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
IGHG1P01857 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
IGHG1P01857 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
IGHG1P01857 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
IGHG1P01857 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
IGHG1P01857 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
IGHG1P01857 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
IGHG1P01857 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
IGHG1P01857 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGHG1P01857 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGHG1P01857 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGHG1P01857 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGHG1P01857 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGHG1P01857 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGHG1P01857 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGHG1P01857 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGHG1P01857 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGHG1P01857 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGHG1P01857 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGHG1P01857 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGHG1P01857 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGHG1P01857 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGHG1P01857 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGHG1P01857 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGHG1P01857 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGHG1P01857 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGHG1P01857 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGHG1P01857 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
IGHG1P01857 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGHG1P01857 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGHG1P01857 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGHG1P01857 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
IGHG1P01857 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGHG1P01857 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGHG1P01857 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGHG1P01857 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGHG1P01857 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGHG1P01857 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGHG1P01857 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGHG1P01857 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGHG1P01857 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGHG1P01857 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGHG1P01857 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGHG1P01857 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGHG1P01857 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGHG1P01857 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGHG1P01857 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGHG1P01857 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGHG1P01857 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGHG1P01857 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGHG1P01857 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGHG1P01857 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGHG1P01857 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGHG1P01857 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGHG1P01857 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGHG1P01857 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGHG1P01857 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGHG1P01857 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
IGHG1P01857 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms